sp. nov.は、中国PRの水洗貯油池の生産水から分離されたものである

sp. nov., isolated from the production water of a water-flooded oil reservoir in PR China.

• Xiao-Tong Wang
• Jian-Jie Shan
• Xi-Zhe Li
• Wei Lin
• Jian-Long Xiu
• Dong-An Li
• Yun-Zeng Zhang
• Lei Wang

抄録

J18株と名付けられた新規の中等度好熱性グラム染色陰性細菌が、水を湛えた貯油池から分離された。細胞は好気性で、酸化酵素およびカタラーゼ陽性で、極性鞭毛を有していた。生育は35〜60℃で、pH6〜8.5で行われた。呼吸性キノンはユビキノン8とユビキノン9であった。細胞性脂肪酸は、C, C cyclo, C cyclo 8, summed feature 8 (C7/C6)が支配的であった。極性脂質は、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルグリセロール、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、未同定アミノ脂質、未同定リン脂質、未同定アミノリン脂質から構成されていた。この菌株は、それぞれDSM 15129（98.6"Zs_200A"％）、DSM 15512（98.4"Zs_200A"％）、DSM 27220（98.1"Zs_200A"％）と16S rRNA遺伝子配列の類似度が最も高く、他種との類似度は93"Zs_200A"％より低かった。系統樹上では属内で唯一のサブクラスターを構成していた。J18株のDNA G+C含量は64.44"Zs_200A"mol%であった。また，J18株のゲノム間距離は，型株と比較して34.7～40"Zs_200A"%であった。これらの結果から，J18株は近縁種とは別種であることが確認された。生理学的、化学運動学的、系統学的解析、全ゲノムレベルでの同一性の低さから、J18株は同属の新種であると結論づけられ、sp.型株はJ18株（=CGMCC 1.16800=LMG 31400）である。

A novel, moderately thermophilic, Gram-stain-negative bacterium, designated strain J18, was isolated from a water-flooded oil reservoir. Cells were aerobic, oxidase- and catalase-positive, with a polar flagellum. Growth occurred at 35-60 °C and at pH 6-8.5. The respiratory quinones were ubiquinone 8 and ubiquinone 9. The dominant cellular fatty acids were C, C cyclo, C cyclo 8 and summed feature 8 (C7/C6). The polar lipids consisted of phosphatidylethanolamine, phosphatidylglycerol, diphosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, an unidentified aminolipid, an unidentified phospholipid and an unidentified aminophospholipid. The strain showed the highest 16S rRNA gene sequence similarities to DSM 15129 (98.6 %), DSM 15512 (98.4 %) and DSM 27220 (98.1 %), respectively, and the similarity to other species was lower than 93 %. In the phylogenetic trees, it constituted a unique sub-cluster within the genus . The DNA G+C content of strain J18 was 64.44 mol%. As compared with the type strains, the genome-to-genome distances of strain J18 were 34.7-40 %. These results confirmed the separate species status of J18 with its close relatives. On the basis of physiological, chemotaxonomic and phylogenetic analyses along with the low levels of identity at the whole-genome level, it can be concluded that strain J18 represents a new species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain of is J18 (=CGMCC 1.16800=LMG 31400).