SARS-CoV-2のエンベロープと膜タンパク質：構造の違いがウイルスの特徴と結びつく？

Sars-CoV-2 Envelope and Membrane Proteins: Structural Differences Linked to Virus Characteristics?

• Martina Bianchi
• Domenico Benvenuto
• Marta Giovanetti
• Silvia Angeletti
• Massimo Ciccozzi
• Stefano Pascarella

抄録

コロナウイルス病2019（COVID-19）は、重症急性呼吸器コロナウイルス2（SARS-CoV-2）による新たなウイルス感染症である。ゲノム解析の結果、SARS-CoV-2はパンゴリンコロナウイルスやコウモリコロナウイルスに関連していることが明らかになった。本報告では、異なるヒト分離株から分離されたSARS-CoV-2のエンベロープおよび膜タンパク質と、近縁のウイルスから分離された相同タンパク質との構造比較を行った。今回の解析では、エンベロープおよび膜タンパク質の構造的類似性が高く、パンゴリンやコウモリのコロナウイルス単離株との構造的類似性が高いことが示されました。その結果、Sars-CoV-2タンパク質に特異的な構造的差異が見られ、これは種を超えた感染やウイルスの性質に関連している可能性があることが明らかになった。構造モデルを用いて、エンベロープと膜タンパク質の予測される3次元構造にバリアント部位をマッピングしました。

The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) is a new viral infection caused by the severe acute respiratory coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Genomic analyses have revealed that SARS-CoV-2 is related to Pangolin and Bat coronaviruses. In this report, a structural comparison between the Sars-CoV-2 Envelope and Membrane proteins from different human isolates with homologous proteins from closely related viruses is described. The analyses here reported show the high structural similarity of Envelope and Membrane proteins to the counterparts from Pangolin and Bat coronavirus isolates. However, the comparisons have also highlighted structural differences specific of Sars-CoV-2 proteins which may be correlated to the cross-species transmission and/or to the properties of the virus. Structural modelling has been applied to map the variant sites onto the predicted three-dimensional structure of the Envelope and Membrane proteins.

Copyright © 2020 Martina Bianchi et al.