α-グロビン鎖バリアントのワイドスペクトル研究。英国からの症例

A Wide Spectrum Study of α-Globin Chain Variants: Cases from the UK.

• Mohamed S M Khalil
• Adele T Timbs
• Shirley J Henderson
• Anna Schuh
• Mohamed M El-Khawanky
• John M Old

抄録

長年にわたり、α-グロビン鎖バリアントが疑われる症例が英国の様々な地域から収集された。その疑いは、臨床像、高速液体クロマトグラフィー（HPLC）バリアント率、保持時間（RT）、等電点収束（IEF）に基づいていた。確定診断には DNA シーケンシングと制限酵素 EI を用いた。2つのα-グロビン遺伝子（, ）のうちの1つまたは両方について、148のバリアントが確認された。これらの症例は、46の異なるα-グロビン鎖バリアントとして同定された。最も一般的な変異体は、Hb J-Meerut [: c.362C>A (または )] (10.1%)とHb Q-India (: c.193G>C) (8.1%)であり、次いでHb J-Paris-I [: c.38C>A (または )]とHb Manitoba II (: c.309C>A) (それぞれ7.4%)であった。他のα変異体は低い頻度で検出された。2つの新規対立遺伝子も検出された。Hb Walsgrave [α116(GH4)Glu→Val (: c.350A>T)]とHb Coombe Park [α127(H10)Lys→Glu (: c.382A>G)]である。民族起源の大部分はインド人であった。HPLC-RT解析によるα変種同定の陽性予測値は65.9％、IEFでは41.9％、RTとIEFの両方を用いた場合は72.1％であった。の遺伝子よりもエキソン１、エキソン２の方がエキソン３よりもバリアント数が多かった。また、連続したコドンにおける変異のクラスタリングは認められなかった。本研究は、広いスペクトルのα-グロビン鎖バリアントの特徴付けを行うことで、増幅不応性変異系ポリメラーゼ連鎖反応（ＡＲＭＳ-ＰＣＲ）パネルによるスクリーニングに先立って、これらのバリアントの推定診断を容易にし、ＤＮＡシークエンシングによる確定診断を行うことが可能である。

Over many years, cases of suspected α-globin chain variants were collected from different parts of the UK. The suspicion was based on the clinical picture, high performance liquid chromatography (HPLC) variant percentage, retention time (RT) and isoelectric focusing (IEF). DNA sequencing and the restriction enzyme EI were used for definitive diagnosis. One hundred and forty-eight variants were confirmed on one or both of the two α-globin genes (, ). These cases were identified as 46 different α-globin chain variants. The most common variants were Hb J-Meerut [: c.362C>A (or )] (10.1%) and Hb Q-India (: c.193G>C) (8.1%), followed by Hb J-Paris-I [: c.38C>A (or )] and Hb Manitoba II (: c.309C>A) (7.4% for each). Other α variants were detected at lower frequencies. Two novel alleles were also detected: Hb Walsgrave [α116(GH4)Glu→Val (: c.350A>T)] and Hb Coombe Park [α127(H10)Lys→Glu (: c.382A>G)]. The majority of the ethnic origin was Indian. The positive predictive value for α variant identification by HPLC-RT analysis was 65.9%, 41.9% by IEF, and using both RT and IEF, the value was 72.1%. The number of variants was higher in than in genes and in exons 1 and 2 than in exon 3. There was no clustering of mutations in consecutive codons. This study, the characterization of a wide spectrum of α-globin chain variants, can facilitate the presumptive diagnosis of these variants prior to screening by a panel of amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction (ARMS-PCR), and a definitive diagnosis by DNA sequencing.