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インド亜大陸ではフレームシフト変異体(c.409dupG)が先天性のサジロ芽球性貧血の原因となっていることが明らかになった
Novel frameshift variant (c.409dupG) in is a common cause of congenital sideroblastic anaemia in the Indian subcontinent.
PMID: 32605921 DOI: 10.1136/jclinpath-2020-206647.
抄録
研究テーマ:
先天性の髄膜芽細胞性貧血(CSA)は、骨髄に環状の髄膜芽細胞が存在する稀な疾患群です。病原性の変異体は常染色体劣性/X連鎖的に遺伝する。本研究の目的は、髄膜芽細胞性貧血患者における変異のスペクトルと遺伝子の特徴を明らかにし、遺伝子型とフェノタイプの相関関係を調べ、再発変異に関連するハプロタイプを同定することである。
AIMS: Congenital sideroblastic anaemias (CSAs) are a group of rare disorders with the presence of ring sideroblasts in the bone marrow. Pathogenic variants are inherited in an autosomal recessive/X-linked fashion. The study was aimed at characterising the spectrum of mutations in and genes in sideroblastic anaemia patients, exploring the genotype-phenotype correlation and identifying the haplotype associated with any recurrent mutation.
患者および方法:
確率の高い CSA 患者 20 例をレトロスペクティブに直接二方向シークエンシングにより、遺伝子の変異と遺伝子について分析した。のプロモーター領域の変異を有する症例では、リアルタイム PCR を用いて遺伝子発現を定量化した。3 つの 1 ヌクレオチド多型を用いて、この遺伝子の再発変異に関連するハプロタイプを確立した。
PATIENTS AND METHODS: Twenty probable CSA patients were retrospectively analysed for genetic variants in and genes by direct bidirectional sequencing. Real-time PCR was used to quantify gene expression in a case with promoter region variant in . Three single nucleotide polymorphisms were used to establish the haplotype associated with a recurrent variant in the gene.
結果:
6例に原因変異があり(30%),11例に原因変異があった(55%).変異例は、症例よりも有意に遅い年齢で提示された。(c.409dupG)のフレームシフト変異は6人の無関係な患者で同定され、「創始者効果」を示す我々の集団では一般的な変異であった。
RESULTS: Six patients had causative variants in (30%) and 11 had variants in (55%). The mutated cases presented at a significantly later age than the cases. A frameshift variant in (c.409dupG) was identified in six unrelated patients and was a common variant in our population exhibiting 'founder effect'.
結論:
本研究は、インド亜大陸から得られた、分子解析を行った最大のサジロ芽球性貧血症例のシリーズである。
CONCLUSION: This is the largest series of sideroblastic anaemia cases with molecular characterisation from the Indian subcontinent.
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