南アフリカにおける多剤耐性臨床分離株におけるカルバペネマーゼ・エンコーディング遺伝子の分子検出

Molecular Detection of Carbapenemase-Encoding Genes in Multidrug-Resistant Clinical Isolates in South Africa.

• Yaw Adjei Anane
• Teke Apalata
• Sandeep Vasaikar
• Grace Emily Okuthe
• Sandile Songca

抄録

序論:

カルバペネム耐性菌が世界的に増加している院内感染の原因となっている。本研究では，臨床的な多剤耐性菌株におけるカルバペネマーゼコード遺伝子の有病率を調査した．

Introduction: Carbapenem-resistant has been responsible for an increasing number of hospital-acquired infections globally. The study investigated the prevalence of carbapenemase-encoding genes in clinical multidrug-resistant strains.

材料と方法:

O.R.タンボ地区の医療施設から得られた臨床検体から，合計100株の多剤耐性菌を培養した。菌株は内在遺伝子を検出することで確認した。抗菌薬感受性試験はVITEK 2およびautoSCAN-4システムを用いて行った。イミペネムとメロペネムのMICはE-testで再確認した。コリスチンのMICはブロスマイクロダイリューション法で確認した。カルバペネマーゼをコードする遺伝子の有無を調べるためにリアルタイムPCRを行った。

Materials and Methods: A total of 100 nonduplicate multidrug-resistant strains were cultured from clinical samples obtained from healthcare facilities in the O. R. Tambo district. The strains were confirmed by detecting the intrinsic gene. Antimicrobial susceptibility testing was performed by VITEK 2 and autoSCAN-4 systems. The MIC of imipenem and meropenem was rechecked by E-test. Colistin MIC was confirmed by the broth microdilution method. Real-time PCR was performed to investigate the presence of carbapenemase-encoding genes.

結果:

その結果、ほとんどの菌株が検査した抗生物質に対して高い耐性率（80％以上）を示した。アミカシンに対する耐性率はそれぞれ50％，テトラサイクリンに対する耐性率は64％，チゲサイクリンに対する耐性率は48％であった．コリスチンに対しては全菌種が完全に感受性を示した。コリスチンは全株で検出されたが，70％，8％，5％，4％，3％，2％で検出された。また，いずれの株でも遺伝子と .と .or の共存は，それぞれ1％，2％の株で認められた。今回の結果の特徴は，2％の株で，遺伝子と .の共存が認められたことであり，南アフリカの東ケープ州では初めての報告である。1は80％の株で検出されたが、IS1/は15％、IS1/は40％の株で検出された。IS1/、IS1/、IS1/、カルバペネマーゼの検出は、イミペネムとメロペネムの両方のMICに有意な影響を与えた。

Results: Most strains showed high resistance rates (>80%) to the antibiotics tested. Resistance to amikacin, tetracycline, and tigecycline were 50%, 64%, and 48%, respectively. All strains were fully susceptible to colistin. The was detected in all strains whilst , , , , , and were found in 70%, 8%, 5%, 4%, 3%, and 2% of strains, respectively. None of the tested strains harboured the genes and . The coexistence of , and or was detected in 1% and 2% strains, respectively. A distinct feature of our findings was the coharbouring of the genes , and in 2% strains, and this is the first report in the Eastern Cape Province, South Africa. The 1 was carried in 80% of tested strains whilst IS1/ and IS1/ were detected in 15% and 40% of the strains, respectively. The detection of , IS1/, IS1/, and , , and carbapenemases in strains had a significant effect on both imipenem and meropenem MICs.

結論:

その結果，当院では高レベルのオキサシリンガーゼ産生が確認され，適切な管理・予防戦略のための局所的な分子サーベイランスの必要性が示唆された．

Conclusions: Results showed a high level of oxacillinases producing circulating in our study setting, highlighting the need for local molecular surveillance to inform appropriate management and prevention strategies.

Copyright © 2020 Yaw Adjei Anane et al.