プラスミドプロファイルに基づくロシアのシベリアおよび極東におけるEnteritidis亜種の遺伝的多様性

Genetic diversity of subsp. serovar Enteritidis in the Siberia and Far East of Russia based on plasmid profiles.

• Alexey V Rakov
• Natalya A Kuznetsova
• Anatoly A Yakovlev

抄録

今回初めて、ロシア、特にシベリアと極東のEnteritidis集団の分子遺伝学的構造を文献レビューで紹介します。ロシアの病原体集団は、世界の様々な国で流通している集団と比較されています。微生物集団は不均質であることが示されているが、総集団の罹患率の最大90％を決定する支配的な遺伝子型と主要な遺伝子型を特定することが可能である。このデータは、30年間（1988年～2018年）のモニタリングの結果、微生物のプラスミドプロファイルを調査した結果得られたものである。同じEnteritidisクローンがロシア全土を循環していることが示されたが、人口罹患率におけるそれらの重要性は地理的・時間的特性によって異なる可能性がある。集団は不均一性とプラスミド型の構造の相対的な安定性によって特徴づけられる。同時に、集団はまた、常に検出されるプラスミド型の年間数の単純な変化として反映される変動性によって規定され、感染症の病因に重要な役割を果たすことができる新しい型の出現によっても規定される。

For the first time, in the literature review we presents the molecular genetic structure of Enteritidis populations in Russia, and particularly, in Siberia and the Far East of the country. Pathogen population in Russia has been compared with populations circulating in different countries of the world. It has been shown that the microbial population is heterogeneous, but it is possible to identify the dominant and main genotypes, which determine up to 90% of the total population morbidity. The data were obtained as a result of a 30-year monitoring (1988 to 2018) by studying the microbial plasmid profiles. It was shown that the same Enteritidis clones circulate throughout Russia, however, their significance in the population morbidity may vary depending on geographic and temporal characteristics. Population is characterized by heterogeneity and relative stability of the plasmid types' structure. At the same time, the population is also specified by variability, reflected as a simple change of the annual number of constantly detected plasmid types, and the appearance of new ones that can play a significant role in the etiology of infection.

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