眼球皮アルビニズムに罹患した中国の405人の血統における病理学的な遺伝的変異のスペクトル

[Spectrum of pathological genetic variants among 405 Chinese pedigrees affected with oculocutaneous albinism].

• Conghui Wang
• Chen Chen
• Xuechao Zhao
• Ganye Zhao
• Lina Liu
• Xiangdong Kong

抄録

目的:

眼球皮膚アルビニズム（OCA）に罹患した中国の血統405人の病理学的遺伝的変異のスペクトルを決定するために。

OBJECTIVE: To determine the spectrum of pathological genetic variants among 405 Chinese pedigrees affected with oculocutaneous albinism (OCA).

方法:

合計405人のOCA患者を収集した。ハイスループットシーケンシング（パネルには TYR、OCA2、TYRP1、SLC45A2 遺伝子を含む）、サンガーシーケンシング、マルチプレックスライゲーション依存性プローブ増幅法（MLPA）を用いて、各サブタイプの遺伝的変異とパターンを解析しました。

METHODS: A total of 405 OCA patients were collected. High-throughput sequencing (The panel included TYR, OCA2, TYRP1 and SLC45A2 genes), Sanger sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) were used to analyze the genetic variants and patterns of each subtype.

結果:

全体の検出率は 79.9%(647/810)であり，検出された変異体はミスセンス変異(57.3% 371/647)，フレームシフト変異(22.9% 148/647)，ナンセンス変異(13.9% 90/647)，スプライシング変異(5.6% 36/647)，マイクロ欠失(0.3% 2/647)などであった．新規バリアントは 36 個検出された．405人の患者のうち、306人が2つのバリアントを持っていた（75.6％、306/405）、35人が1つのバリアントを持っていた（8.6％、35/405）、64人の患者ではバリアントが検出されなかった。遺伝的に診断された306人のOCA患者のうち，OCA1が最も多く（74.5％，228/306人），OCA2（15.0％，46/306人），OCA3（0.7％，2/306人），OCA4（9.8％，30/306人）と比較して，それぞれOCA2が最も多かった．1人の患者は、TYRP1遺伝子のホモ接合c.1262-4_c.1262-3insTAGA変異を保有していることが判明した。もう一人の患者は、TYRP1遺伝子のc.1214C>A (p.T405N)およびc.1338delinsCG(p.V447Gfs*19)の複合ヘテロ接合型変異体を保有していた。

RESULTS: The overall detection rate of genetic variants was 79.9% (647/810), and the variants included missense variants (57.3%, 371/647), frameshift variants (22.9%, 148/647), nonsense variants (13.9%, 90/647), splicing variants (5.6%, 36/647), and microdeletions (0.3%, 2/647). Thirty-six novel variants were detected. Of the 405 patients, 306 have carried 2 variant alleles (75.6%, 306/405), 35 carried 1 variant alleles (8.6%, 35/405), while no variant was detected in 64 patients. Among the 306 genetically diagnosed OCA patients, OCA1 was the most common form (74.5%, 228/306), compared with OCA2 (15.0%, 46/306), OCA3 (0.7%, 2/306) and OCA4 (9.8%, 30/306), respectively. One patient was found to harbor homozygous c.1262-4_c.1262-3insTAGA variant of the TYRP1 gene. Another patient was found to carry compound heterozygous variants of c.1214C>A (p.T405N) and c.1338delinsCG(p.V447Gfs*19) of the TYRP1 gene.

結論:

サンガーシークエンシングとMLPAを組み合わせたハイスループットシークエンシングにより、OCAに関連する遺伝的変異を効果的に検出することができる。上記の知見はOCAの変異スペクトルを拡大し、中国におけるOCAの遺伝的および出生前診断を容易にすることができる。

CONCLUSION: High-throughput sequencing in combination with Sanger sequencing and MLPA can effectively detect genetic variants associated with OCA. Above finding has expanded variant spectrum of OCA, which can facilitate genetic and prenatal diagnosis of this disease in China.