左右の大腸がんの生物学的経路に関連するマイクロRNA

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Anticancer Res..2020 Jul;40(7):3713-3722. 40/7/3713. doi: 10.21873/anticanres.14360.

左右の大腸がんの生物学的経路に関連するマイクロRNA

MicroRNAs Associated With Biological Pathways of Left- and Right-sided Colorectal Cancer.

Stralina Eneh
Sami Heikkinen
Jaana M Hartikainen
Teijo Kuopio
Jukka-Pekka Mecklin
Veli-Matti Kosma
Arto Mannermaa

PMID: 32620610 DOI: 10.21873/anticanres.14360.

抄録

背景・目的:

マイクロRNA（miRNA）は大腸がん（CRC）の発生を制御している。我々は、部位特異的CRCにおけるmiRNAと癌関連シグナル伝達経路との関連を調査することを目的とした。

BACKGROUND/AIM: MicroRNAs (miRNAs) regulate the development of colorectal cancer (CRC). We aimed to investigate miRNAs and their relation to cancer-related signaling pathways in site-specific CRC.

材料と方法:

フィンランドの左右合計24例のCRCサンプル（発見コホート）と、201例のCRCサンプルのThe Cancer Genome Atlas公開成熟miRSeqデータセット（バリデーションコホート）を使用した。MiRNAの差分発現および生物学的経路の解析は、それぞれDESeq2およびDIANA/mirPathツールを用いて行った。

MATERIALS AND METHODS: We used a total of 24 left- and right-sided Finnish CRC samples (discovery cohort) and The Cancer Genome Atlas public mature miRSeq dataset of 201 CRC samples (validation cohort). MiRNA differential expression and biological pathway analyses were performed using DESeq2 and the DIANA/mirPath tool, respectively.

結果:

左側のCRCでは17個のmiRNA（以下、左miRNA）、右側のCRCでは15個のmiRNA（以下、右miRNA）が、有意に異なるアップレギュレーション（偽発見率（FDR）＜0.05）を示しました。左側のmiRNAはmTor、Wnt、PI3K-Aktシグナル伝達経路に関与している（FDR<0.05）。右のmiRNAはTGF-βシグナル伝達経路に参加している。また、両コホートには6つのmiRNAが共有されていることが観察されました。そのうちの1つ(hsa-miR-196b-5p)は左側CRCで有意に(FDR<0.05)アップレギュレーションされていた。残りのmiRNA（hsa-miR-625-3p、hsa-miR-155-5p、hsa-miR-625-5p、hsa-miR-31-5p、およびhsa-miR-330-5p）は右側CRCで有意（FDR<0.05）なアップレギュレーションを示した。

RESULTS: We found 17 significantly differentially up-regulated [false discovery rate (FDR) <0.05] miRNAs in left-sided CRC ("left miRNAs"), and 15 in right-sided CRC ("right miRNAs"). The left miRNAs participate in the mTor, Wnt, PI3K-Akt signaling pathways (FDR<0.05). The right miRNAs participate in the TGF-β signaling pathway. We also observed that both cohorts share six miRNAs. One of these (hsa-miR-196b-5p) was significantly (FDR<0.05) up-regulated in left-sided CRC. The rest of them (hsa-miR-625-3p, hsa-miR-155-5p, hsa-miR-625-5p, hsa-miR-31-5p and hsa-miR-330-5p) showed significant (FDR<0.05) up-regulation in right-sided CRC.

結論:

左右のmiRNAは、それぞれ左側のCRCと右側のCRCの優勢な生物学的経路と関連している。これらの結果は、CRCの分類や部位特異的CRCのバイオマーカー研究に役立つ可能性がある。

CONCLUSION: Left and right miRNAs are associated with predominant biological pathways of left- and right-sided CRC, respectively. Our results may be beneficial for classifying CRC and for future biomarker studies of site-specific CRC.