HIV-1創始者変異体の数は、発信者パートナーの感染の再頻度によって決定される

Number of HIV-1 founder variants is determined by the recency of the source partner infection.

• Ch Julián Villabona-Arenas
• Matthew Hall
• Katrina A Lythgoe
• Stephen G Gaffney
• Roland R Regoes
• Stéphane Hué
• Katherine E Atkins

抄録

性的感染の際には、個人内のHIV-1の高い遺伝的多様性が、感染を開始する1つの創始者バリアントにまで低下することが多い。このボトルネックの原因を理解することは、効果的な感染制御戦略を開発する上で極めて重要である。このボトルネックにおける感染源パートナーの重要性については、ほとんど知られていない。感染源パートナーがHIV創始者バリアントの数に影響を与えるという仮説を検証するために、我々は、感染源パートナーの感染方向と感染段階がわかっているすべての既存の感染ペアについて、遺伝学的および疫学的データを用いて校正された系統力学的モデルを開発した。その結果、急性期（初期）の感染者からの感染は、慢性期（後期）の感染者からの感染と比較して、複数のファウンダー変異体の感染リスクを高めることが示唆された。この研究は、複数のファウンダー株感染の頻度の低さを説明するために、感染源となるパートナーの特徴を直接検証した最初の研究を提供するものである。

During sexual transmission, the high genetic diversity of HIV-1 within an individual is frequently reduced to one founder variant that initiates infection. Understanding the drivers of this bottleneck is crucial to developing effective infection control strategies. Little is known about the importance of the source partner during this bottleneck. To test the hypothesis that the source partner affects the number of HIV founder variants, we developed a phylodynamic model calibrated using genetic and epidemiological data on all existing transmission pairs for whom the direction of transmission and the infection stage of the source partner are known. Our results suggest that acquiring infection from someone in the acute (early) stage of infection increases the risk of multiple-founder variant transmission compared with acquiring infection from someone in the chronic (later) stage of infection. This study provides the first direct test of source partner characteristics to explain the low frequency of multiple-founder strain infections.

Copyright © 2020, American Association for the Advancement of Science.