細菌を標的としたワクチンや薬剤の探索のための体系的な戦略

A systematic strategy for the investigation of vaccines and drugs targeting bacteria.

• Fangfang Yan
• Feng Gao

抄録

細菌が引き起こす感染症や流行性疾患は、歴史的に人々に大きな苦痛を与え、世界中で多くの死者を出してきました。現在、多くの研究者が、比較減算ゲノム、コアゲノム、複製関連タンパク質、トランスクリプトミクス、リボスイッチの解析など、複数の手法を駆使して、細菌を標的とした生存可能な薬剤やワクチンの探索に取り組んでおり、感染症や流行病の治療に大きな役割を果たしています。ターゲット解析により、所望の標的タンパク質、薬剤、エピトープの3次元構造を予測し、モデル化することができる。一方、構築された薬物/エピトープ-タンパク質複合体の分子動力学（MD）解析は、これらのスクリーニングされた薬物やワクチンの適合性をテストするための重要な基準となっています。現在、標的探索、標的解析、MD解析は、細菌のための薬物・ワクチン解析戦略の体系的なセットに統合されています。この総合的な戦略が、高性能なワクチンや薬剤の設計に役立つことを期待しています。

Infectious and epidemic diseases induced by bacteria have historically caused great distress to people, and have even resulted in a large number of deaths worldwide. At present, many researchers are working on the discovery of viable drug and vaccine targets for bacteria through multiple methods, including the analyses of comparative subtractive genome, core genome, replication-related proteins, transcriptomics and riboswitches, which plays a significant part in the treatment of infectious and pandemic diseases. The 3D structures of the desired target proteins, drugs and epitopes can be predicted and modeled through target analysis. Meanwhile, molecular dynamics (MD) analysis of the constructed drug/epitope-protein complexes is an important standard for testing the suitability of these screened drugs and vaccines. Currently, target discovery, target analysis and MD analysis are integrated into a systematic set of drug and vaccine analysis strategy for bacteria. We hope that this comprehensive strategy will help in the design of high-performance vaccines and drugs.

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