Arthroderma属の3遺伝子系統。今後の分類学的研究の基礎となる

Three-gene phylogeny of the genus Arthroderma: Basis for future taxonomic studies.

• Steven Hainsworth
• Ivana Kučerová
• Rahul Sharma
• Connie F Cañete-Gibas
• Vit Hubka

抄録

Arthrodermaは皮膚糸状菌の中で最も多様性の高い属であり、土壌、洞窟、動物の巣、臨床材料、その他の環境に生息する種を含んでいる。本研究では、現在認められているすべてのArthroderma種のex-type、参照株および真正株を収集し、3つの高可変性遺伝子座（ITS rDNA、β-tubulin、翻訳伸長因子1-α）の配列を作成した。受け入れられた種の数は27種に拡大された。1つの新種、A. melbournense (ex-type strain CCF 6162T=CBS 145858T)が記載されている。この種は、東オーストラリアの4つの地域の疫学調査中に、メルボルンの足病医が採取した足の爪の粉塵から分離された。Trichophyton terrestre, Chrysosporium magnisporum, Chrysosporium oceanitisはArthrodermaに移行している。T. terrestreについては、旧T. terrestre複合体の生物種であるA. insingulare, A. lenticulare, A. quadrifidumのいずれとも類型化されていないことが示されている。本研究で得られた多遺伝子系統と参照配列は、今後の系統研究の基礎となり、実際に種の同定を容易にするものである。

Arthroderma is the most diverse genus among dermatophytes encompassing species occurring in soil, caves, animal burrows, clinical material and other environments. In this study, we collected ex-type, reference and authentic strains of all currently accepted Arthroderma species and generated sequences of three highly variable loci (ITS rDNA, β-tubulin, and translation elongation factor 1-α). The number of accepted species was expanded to 27. One novel species, A. melbournense (ex-type strain CCF 6162T = CBS 145858T), is described. This species was isolated from toenail dust collected by a podiatrist in Melbourne, during an epidemiological study of four geographical regions of Eastern Australia. Trichophyton terrestre, Chrysosporium magnisporum, and Chrysosporium oceanitis are transferred to Arthroderma. Typification is provided for T. terrestre that is not conspecific with any of the supposed biological species from the former T. terrestre complex, that is, A. insingulare, A. lenticulare and A. quadrifidum. A multi-gene phylogeny and reference sequences provided in this study should serve as a basis for future phylogenetic studies and facilitate species identification in practice.

レイアブストラクト:

Arthroderma属は、ヒトや動物の表在性感染症の原因となることはまれであるが、地表性の皮膚糸状菌を含んでいる。現在認められているすべてのArthroderma種について、3つの遺伝子座からの参照配列を生成し、系統を構築した。また、いくつかの分類学的新規性が紹介されている。新たに提供されたデータは、種の同定と将来の分類学的研究を容易にするものである。

LAY ABSTRACT: The genus Arthroderma encompasses geophilic dermatophyte species that infrequently cause human and animal superficial infections. Reference sequences from three genetic loci were generated for all currently accepted Arthroderma species and phylogeny was constructed. Several taxonomic novelties are introduced. The newly provided data will facilitate species identification and future taxonomic studies.

© The Author(s) 2020. Published by Oxford University Press on behalf of The International Society for Human and Animal Mycology.