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日本語AIでPubMedを検索

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Iran J Pharm Res.2019;18(3):1253-1263. doi: 10.22037/ijpr.2019.1100746.

抗HIV-1剤としての2-ベンゾオキサゾリノン、キナゾリン、ジアゾクマリン誘導体の分子ドッキングとQSAR研究

Molecular Docking and QSAR Study of 2-Benzoxazolinone, Quinazoline and Diazocoumarin Derivatives as Anti-HIV-1 Agents.

  • Kamyar Kamyar
  • Mahdieh Safakish
  • Tannaz Zebardast
  • Zahra Hajimahdi
  • Afshin Zarghi
PMID: 32641936 PMCID: PMC6934961. DOI: 10.22037/ijpr.2019.1100746.

抄録

2-ベンゾオキサゾリノン、ジアゾクマリン、キナゾリン誘導体は、細胞培養において HIV 複製を阻害することが示されている。選択された分子のファーマコフォア特性を理解し、新規抗HIV薬を設計するために、ステップワイズ法に基づく記述子選択法を用いて、定量的構造活性相関法(QSAR)研究を開発した。重回帰法を用いて、データセットの分子の抗 HIV 活性と選択した記述子との関連付けを行った。得られたQSARモデルは、相関係数Rが0.84、離脱係数Qが0.73と統計的に有意であった。このモデルは、0.79の十分な予測値(R)を与えるテストセット分子によって検証された。分子はまた、HIVインテグラーゼ酵素にドッキングされ、酵素活性部位の重要な残基との重要な相互作用を示した。これらのデータは、新規抗HIV化合物の設計や発見に役立つ可能性がある。

A series of 2-benzoxazolinone, diazocoumarin and quinazoline derivatives have been shown to inhibit HIV replication in cell culture. To understand the pharmacophore properties of selected molecules and design new anti-HIV agents, quantitative structure-activity relationship (QSAR) study was developed using a descriptor selection approach based on the stepwise method. Multiple linear regression method was applied to relate the anti-HIV activities of dataset molecules to the selected descriptors. Obtained QSAR model was statistically significant with correlation coefficient R of 0.84 and leave one out coefficient Q of 0.73. The model was validated by test set molecules giving satisfactory prediction value (R) of 0.79. Molecules also were docked on HIV integrase enzyme and showed important interactions with the key residues in enzyme active site. These data might be helpful for design and discovery of novel anti-HIV compounds.