中国ホルスタイン牛における遺伝子のコピー数変異と乳汁形質との関連

Copy number variation of the gene and its association with milk traits in Chinese Holstein cattle.

• Yifan Wen
• Hua He
• Hongbing Liu
• Qingming An
• Dahui Wang
• Xiaoting Ding
• Qiaoting Shi
• Yajie Feng
• Eryao Wang
• Chuzhao Lei
• Zijing Zhang
• Yongzhen Huang

抄録

CNV（Copy number variation）は、多くの種で遺伝的変異とされている一塩基多型（SNP）や挿入欠失（InDel）に類似したものである。CNVとは、参照ゲノムと比較してDNAセグメントの長さが変化することであり、50bpから数メガ塩基までの増減を含むと定義されています。遺伝子の機能は、細胞周期の制御、DNA損傷、ヒストンH2Aの脱ユビキチン化、有糸分裂の核分裂など多岐にわたっています。遺伝子のCNVと中国ホルスタインの乳房形質との関係を解析するために、qPCRを用いて中国ホルスタインの個体（＝180頭）を検出した。その結果、日量乳量と脂肪率に対する遺伝子CNVの影響には有意差があった（<0.05）。その結果、日量と脂肪率には遺伝子CNVの影響に有意な差が見られた(&lt;0.05)。このことから、遺伝子の CNV は中国産ホルスタインの乳質形質の重要な因子であることがわかりました。一方、中国ホルスタインの乳房形質の選択を支援するための分子マーカーとして利用できる可能性があり、中国における牛種の遺伝的改良の理論的基礎を提供するものである。

Copy number variations (CNVs) were similar to single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertion-deletion (InDel), regarded as genetic variations in many species. CNV is defined as the variable change of DNA segment length compared with the reference genome, including gains or losses from 50 bp to several mega bases. The functions of gene are diverse, such as regulating the cell cycle, DNA damage, histone H2A deubiquitination or mitotic nuclear division. To analyze the relationship between CNV of gene and milk traits in Chinese Holstein, we used qPCR to detect the individuals of Chinese Holstein ( = 180). The results showed that the effect of gene CNV on daily milk yield and fat percentage had significant difference ( < 0.05). The gain was the advantage type in daily milk yield and the loss was the advantage type in fat percentage. Therefore, CNV of gene is an important factor of milk traits in Chinese Holstein. Meanwhile, it may be used as a molecular marker for assisted selection of milk traits in Chinese Holstein, which provides a theoretical basis for the genetic improvement of cow breeds in China.