トランスクリプトーム解析により、29歳のファバ豆サンプルのゲノム配列が明らかに

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Microbiol Resour Announc.2020 Jul;9(28). e00673-20. doi: 10.1128/MRA.00673-20.Epub 2020-07-09.

トランスクリプトーム解析により、29歳のファバ豆サンプルのゲノム配列が明らかに

Transcriptome Sequencing Reveals the Genome Sequence of from a 29-Year-Old Faba Bean Sample.

S Maina
L Zheng
S King
V L McQueen
S L Norton
B Rodoni

PMID: 32646910 PMCID: PMC7348028. DOI: 10.1128/MRA.00673-20.

抄録

PEBVは土壌中に生息する三臭線虫や種子を介して感染する。トランスクリプトームシークエンス法を用いた後、アセンブリーすることにより、PEBVリビア単離株LyV66-91のゲノムを明らかにした。そのRNA1は英国分離株SP5と93.91％、RNA2はオランダ分離株E116と63.32％の同一性を有していた。

(PEBV) is transmitted by soil-inhabiting trichodorid nematodes and via seeds. The transcriptome sequencing method, followed by assembly, revealed the PEBV Libyan isolate LyV66-91 genome. Its RNA1 resembled that of UK isolate SP5 with 93.91% nucleotide identity, and its RNA2 had 63.32% nucleotide identity to that of Dutch isolate E116.