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ドイツで分離されたSpartina mottle virusの完全なゲノム配列から，Potyviridae（ポチウイルス科）の属名「Sparmovirus」に分類されることが明らかになった．
Complete genome sequence of a German isolate of spartina mottle virus supports its classification as a member of the proposed genus "Sparmovirus" within the family Potyviridae.
PMID: 32647930 DOI: 10.1007/s00705-020-04726-z.
抄録
Spartina mottle virus (SpMV)は、Potyviridae科の未分類のウイルスであり、1980年にイギリスとウェールズでSpartina属の症状のある植物で初めて報告されて以来、知られています。感染した細胞では、ポチウイルスに類似した屈曲性粒子やピンホイール包接体が発見された。現在までのところ、NCBIのデータベースには、ドイツ（Nessmersiel）とイタリア（Assisi）から分離された2つの部分的な配列しか登録されておらず、SpMVはポチウイルス科の"Sparmovirus"と呼ばれる新しい属の最初のメンバーである可能性が示唆されています。本研究では、ドイツのSpMV分離株（SpMV Ger）の最初の完全なゲノム配列が決定された。SpMVのゲノムは、9376ヌクレオチドからなる一本鎖のポリアデニル化RNAである。配列解析の結果、多くの保存された特徴を含む、古典的なポチウイルスと類似したゲノム構造を有していることが明らかになった。系統解析では，SpMVは既知のどの属にも属すことができなかったが，ライモウイルスやコモンリードクロロティックストライプウイルス（CRCSV，未分類）と最も近い関係を示した．配列比較の結果、SpMV、CRCSV、およびSpMVの発散株と考えられる3つのバミューダグラスモザイクウイルス分離株を含む新属が確立されるべきであることが確認された。
Spartina mottle virus (SpMV), an unassigned member of the family Potyviridae, has been known since 1980, when it was first described in England and Wales in symptomatic plants of the genus Spartina. In infected cells, flexuous particles and pinwheel inclusion bodies were found that resemble those of potyvirids. To date, the NCBI database contains only two partial sequences of a German (Nessmersiel) and an Italian (Assisi) isolate, suggesting that SpMV could be the first member of a new genus, called "Sparmovirus", in the family Potyviridae. In this study, the first complete genome sequence of the German SpMV isolate (SpMV Ger) was determined. The genome of SpMV is a single-stranded, monopartite, polyadenylated RNA consisting of 9376 nucleotides. Sequence analysis revealed a genome organization similar to that of classical potyviruses, including many conserved features. In phylogenetic analysis, SpMV could not be assigned to any of the known genera, but it showed the closest relationship to rymoviruses and common reed chlorotic stripe virus (CRCSV, unassigned). Sequence comparisons confirmed that a new genus should be established containing SpMV, CRCSV, and three Bermuda grass mosaic virus isolates, which are considered divergent strains of SpMV.