魚のフィレの分類学的地位の迅速な決定のためのMALDI MSによる魚類間の距離の可視化

Visualization of the Distance Among Fishes by MALDI MS for Rapid Determination of the Taxonomic Status of Fish Fillets.

• Chengyu Wang
• Hongyan Bi
• Jing Xie

抄録

分類学的研究は生物の分類において重要な役割を果たしている。分子法は種の分類学的状態を決定するための有用な手段であるが、時間がかかり、費用対効果が高くないことが多い。ここでは、魚のサンプルを迅速に分析する方法を開発した。実験的には、魚の切り身をトリフルオロ酢酸（TFA）水溶液で前処理し、得られたタンパク質画分をマトリックス支援レーザー脱離イオン化質量分析法（MALDI MS）で分析した。その結果、魚介類の分類学的距離を可視化するために、質量分析データの主成分分析(PCA)を行った。その結果は、魚類関係の距離を可視化できるツリーマップで示された。得られた質量分析結果は参考にして、未知の魚のフィレの同定に利用することができました。本研究で得られた結果は、不明瞭な魚類の分類学的研究の手がかりとなり、魚類の同定にも活用できると考えられます。

Taxonomic research plays an important role in the classification of organisms. Molecular techniques provide useful tools for the determination of the taxonomic status of species, though are often time-consuming, and not cost-efficient. Herein, we developed a strategy to analyze fish samples in a rapid mode. Experimentally, fish fillet samples were pretreated with trifluoroacetic acid (TFA) aqueous solution, and the obtained protein fraction was analyzed by matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI MS). Principal component analysis (PCA) of mass spectrometric datasets was used to visualize the taxonomical distance among the analyzed thirteen seafood species. The results were illustrated by treemaps where the fish relationship distance can be visualized. The obtained mass spectral results can be taken as reference and successfully used for the identification of unknown fish fillet samples. It is promising to utilize the present strategy to provide clues for the taxonomy study among ambiguous species and identify fish species.