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ベクターオミクスの最新の進歩と将来の展望
Recent advances and future perspectives in vector-omics.
PMID: 32650287 DOI: 10.1016/j.cois.2020.05.006.
抄録
ベクターオミクスにおける最近の進歩と残された課題をレビューした。また、基準品質のゲノムアセンブリーを達成すること以上に、新たな生物学的洞察を促進する技術やアプリケーションをいくつか取り上げた。他のトピックとしては、クロマチンコンフォメーションキャプチャー、クロマチンアクセシビリティアッセイ、オプティカルマッピング、全長RNAシークエンシング、単細胞RNA解析、プロテオミクス、集団ゲノミクスなどの応用について議論してきました。ベクターオミクス研究は、幅広い種への応用だけでなく、新規な遺伝的要素を明らかにし、これまでアクセスできなかったゲノムの領域に取り組むことができるという点でも、大きな広がりを見せてくれるものと期待しています。装置の移植性、コスト削減、情報学的サポートにおける継続的な技術革新により、ベクターオミクスが世界中のすべてのベクター研究室やフィールドステーションに導入され、基礎研究やベクターが媒介する感染症の制御に比類のない影響を与えることを、私たちは願っています。
We have reviewed recent progress and the remaining challenges in vector-omics. We have highlighted several technologies and applications that facilitate novel biological insights beyond achieving a reference-quality genome assembly. Among other topics, we have discussed the applications of chromatin conformation capture, chromatin accessibility assays, optical mapping, full-length RNA sequencing, single cell RNA analysis, proteomics, and population genomics. We anticipate that we will witness a great expansion in vector-omics research not only in its application in a broad range of species, but also its ability to uncover novel genetic elements and tackle previously inaccessible regions of the genome. It is our hope that the continued innovation in device portability, cost reduction, and informatics support will in the foreseeable future bring vector-omics to every vector laboratory and field station in the world, which will have an unparalleled impact on basic research and the control of vector-borne infectious diseases.
Copyright © 2020. Published by Elsevier Inc.