日本語AIでPubMedを検索
腸内ファージ-細菌関連のメタゲノムデータは、病原体に対するファージ治療法の開発を支援する
Metagenome Data on Intestinal Phage-Bacteria Associations Aids the Development of Phage Therapy against Pathobionts.
PMID: 32652061 DOI: 10.1016/j.chom.2020.06.005.
抄録
バクテリオファージ（ファージ）の応用は、腸内病原菌排除のための特異性の高い治療法として提案されている。しかし、ファージ治療法の開発に不可欠な情報であるファージとヒト腸内細菌との感染関連は、まだ十分に解明されていない。本研究では、日本人健常者101名の腸内ウイルスマイクロバイオーム（viromes）と細菌マイクロバイオーム（bacteriomes）を報告した。同じ糞便サンプルから得られたバクテリオームとビロメのゲノム配列に基づいて、温帯性ファージと病原性ファージの両方について、宿主細菌とファージの関連性を示した。包括的な宿主細菌-ファージ情報の有用性を検証するために、Clostridioides difficile 固有のファージをスクリーニングし、その活性がインビトロとインビボの両方で確認されている抗菌酵素を同定しました。これらの包括的なメタゲノム解析により、ヒト腸内の宿主細菌とファージの関連性が明らかになっただけでなく、腸内病原体に対するファージ治療法の開発に不可欠な情報が得られました。
The application of bacteriophages (phages) is proposed as a highly specific therapy for intestinal pathobiont elimination. However, the infectious associations between phages and bacteria in the human intestine, which is essential information for the development of phage therapies, have yet to be fully elucidated. Here, we report the intestinal viral microbiomes (viromes), together with bacterial microbiomes (bacteriomes), in 101 healthy Japanese individuals. Based on the genomic sequences of bacteriomes and viromes from the same fecal samples, the host bacteria-phage associations are illustrated for both temperate and virulent phages. To verify the usefulness of the comprehensive host bacteria-phage information, we screened Clostridioides difficile-specific phages and identified antibacterial enzymes whose activity is confirmed both in vitro and in vivo. These comprehensive metagenome analyses reveal not only host bacteria-phage associations in the human intestine but also provide vital information for the development of phage therapies against intestinal pathobionts.
Copyright © 2020 Elsevier Inc. All rights reserved.