LPAR1, Correlated with Immune Infiltrates, Is a Potential Prognostic Biomarker in Prostate Cancer

LPAR1, Correlated With Immune Infiltrates, Is a Potential Prognostic Biomarker in Prostate Cancer.

• Jingqi Shi
• Dongbo Jiang
• Shuya Yang
• Xiyang Zhang
• Jing Wang
• Yang Liu
• Yuanjie Sun
• Yuchen Lu
• Kun Yang

抄録

前立腺がんは世界的に男性に多い悪性腫瘍である。リソホスファチジン酸受容体1（LPAR1）は重要な遺伝子であり、腫瘍の多様な生物学的機能を媒介しています。しかし、LPAR1と前立腺癌の予後との相関関係や、そのメカニズムについては不明な点が多い。本研究では、The Cancer Genome Atlas（TCGA）と Oncomine データベースを用いて LPAR1 の発現解析を行った。また、予後とLPAR1の相関関係をR studioを用いて解析した。LPAR1と腫瘍浸潤免疫細胞との関連については、R studioのTumor Immune Estimation Resource site、ssGSEA、MCPcounterパッケージを用いて評価した。LPAR1の機能解析には、Gene Set Enrichment AnalysisとGene Ontology解析を用いた。TCGAデータセットとOncomineデータベースから、LPAR1は前立腺がんで有意に発現が低下していることが明らかになった。LPAR1 の発現が高いことは、良好な全生存期間と相関していた。LPAR1 は免疫細胞の活性化、増殖、分化、移動に関与しており、その発現は CD4+ T 細胞、B 細胞、CD8+ T 細胞、好中球、マクロファージ、樹状細胞、ナチュラルキラー細胞を含む免疫浸潤と正の相関があった。さらに、LPAR1の発現は、これらのケモカイン/ケモカイン受容体と正の相関があり、LPAR1が免疫細胞の遊走を制御している可能性があることを示しています。以上のことから、LPAR1は予後のバイオマーカーとしての可能性があり、前立腺癌の免疫浸潤に重要な役割を果たしていることが示唆された。

Prostate cancer is a common malignancy in men worldwide. Lysophosphatidic acid receptor 1 (LPAR1) is a critical gene and it mediates diverse biologic functions in tumor. However, the correlation between LPAR1 and prognosis in prostate cancer, as well as the potential mechanism, remains unclear. In the present study, LPAR1 expression analysis was based on The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the Oncomine database. The correlation of LPAR1 on prognosis was also analyzed based on R studio. The association between LPAR1 and tumor-infiltrating immune cells were evaluated in the Tumor Immune Estimation Resource site, ssGSEA, and MCPcounter packages in R studio. Gene Set Enrichment Analysis and Gene Ontology analysis were used to analyze the function of LPAR1. TCGA datasets and the Oncomine database revealed that LPAR1 was significantly downregulated in prostate cancer. High LPAR1 expression was correlated with favorable overall survival. LPAR1 was involved in the activation, proliferation, differentiation, and migration of immune cells, and its expression was positively correlated with immune infiltrates, including CD4+ T cells, B cells, CD8+ T cells, neutrophils, macrophages, dendritic cells, and natural killer cells. Moreover, LPAR1 expression was positively correlated with those chemokine/chemokine receptors, indicating that LPAR1 may regulate the migration of immune cells. In summary, LPAR1 is a potential prognostic biomarker and plays an important part in immune infiltrates in prostate cancer.

Copyright © 2020 Shi, Jiang, Yang, Zhang, Wang, Liu, Sun, Lu and Yang.