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Chromophobe Renal Cell Carcinomaにおける4倍体化の検出：洞察と落とし穴
Detection Of Tetraploidization In Chromophobe Renal Cell Carcinoma: Insights And Pitfalls.
PMID: 32658344 DOI: 10.1002/gcc.22886.
抄録
著しい二倍体欠損をもたらす染色体欠損は、腎臓癌の中で3番目に頻度の高いタイプの腎細胞癌（Chromophobe renal cell carcinoma: ChRCC）の特異性である。その検出は困難な症例では有用である。しかし、ChRCCの中には、特に好酸球性の変異型では二倍体性を示さないものもあり、今後の研究が必要とされています。比較ゲノムハイブリダイゼーション（アレイCGH）を用いて、非転移性ChRCCの5例で染色体の増加を観察した。我々の目的は、これらの明らかな染色体の増加が、ほぼ多型のゲノム内での損失であるかどうかを明らかにすることであった。われわれは、643例の腎腫瘍のうち26例（2012年～2019年）のChRCCを対象に、レトロスペクティブおよびプロスペクティブな分子生物学的研究を行った。すべての腫瘍を、アレイ-CGH（アジレント）とアレイ-CGH（アフィメトリクス）を用いて、一塩基多型解析（アレイ-SNP）に結合して解析した。多形性が疑われる5例について、インシリコ手動集中化、蛍光in situハイブリダイゼーション（FISH）、次世代シークエンシングを行った。我々のシリーズのChRCCの19%で4倍体化が観察された。個々に使用した方法のいずれも、染色体欠損と四倍体化の両方を同定することはできなかった。アレイ-CGHとFISHの手動リセンタリングの組み合わせのみが、関連する結果をもたらした。Bアレル頻度の結果から、4例では染色体欠損に次いで4倍体化が発生したが、1例では欠損に先行していた。四倍体化はChRCCでは頻繁に起こるが、過小評価されている現象であり、個々の標準的なゲノム解析法では見落とされている可能性がある。その潜在的な臨床的影響はまだ特定されていない。ChRCCにおける染色体欠損を誘発するメカニズムが、4倍体化を引き起こすメカニズムと同じであるかどうかは不明である。この記事は著作権で保護されています。すべての権利を保有しています。
Chromosomal losses resulting in a marked hypodiploidy are a specificity of chromophobe renal cell carcinoma (ChRCC), the third most frequent type of kidney cancer. Its detection is useful in challenging cases. However some ChRCC, especially the eosinophilic variant, do not exhibit hypodiploidy and deserve to be better explored. Using comparative genomic hybridization (array-CGH) we observed chromosomal gains in five cases of non-metastatic ChRCC. Our objective was to determine whether these apparent chromosomal gains were instead losses within a near-polyploid genome. We performed a retrospective and prospective molecular study of 26 cases of ChRCC retrieved among 643 renal tumors (2012-2019). All tumors were analyzed using array-CGH (Agilent) and array-CGH (Affymetrix) coupled to single nucleotide polymorphism analysis (array-SNP). In silico manual centralization of the fluorescence ratio, fluorescence in situ hybridization (FISH) and next generation sequencing were made in the five cases suspected of polyploidy. Tetraploidization was observed in 19% of our series of ChRCC. None of the methods used individually could identify both chromosomal losses and tetraploidy. Only the combination of manual recentring of array-CGH and FISH provided relevant results. B-allele frequency results indicated that tetraploidization occurred secondarily to chromosomal losses in four cases while it preceded losses in one case. Tetraploidization is a frequent but underestimated phenomenon in ChRCC that may be overlooked using the individual standard genomic methods. Its potential clinical consequences are not identified yet. Whether the mechanisms that induce chromosomal losses in ChRCC are the same that generate tetraploidization is not known. This article is protected by copyright. All rights reserved.
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