異なる樹齢におけるCasuarina equisetifoliaの根圏・根圏微生物群集の構造的多様性とニッチ分化

Structural variability and niche differentiation of the rhizosphere and endosphere fungal microbiome of Casuarina equisetifolia at different ages.

• Rui Huang
• Pan Chen
• Xuan Wang
• Huimin Li
• Linzhi Zuo
• Yaqian Zhang
• Lei Li

抄録

背景:

カスアリナ（Casuarina equisetifolia）は、防風、土壌侵食、砂丘の安定化のために、中国南部の海岸沿いに人工的に植えられた最も重要な保護林の一つである。そのため、土壌の栄養価が低く、微生物の活動が低下していることが原因と考えられている。

BACKGROUND: Casuarina equisetifolia is one of the most important artificially planted protective forests along the coast in southern China for windbreaks, soil erosion, and sand dune stabilization. Self-renewing of C. equisetifolia is very limited, which might be caused by low soil nutrient levels and reduced microbial activity.

方法:

18S rDNAのハイスループットシークエンシングを用いて、若齢林、中齢林、成熟林のC. equisetifoliaの根圏と根内圏の微生物群集を調査した。

METHODS: Use of high-throughput sequencing of the 18S rDNA to investigate the microbial communities from the rhizosphere and root endosphere of C. equisetifolia in young-aged, intermediate-aged, and mature-aged forests.

結果:

その結果、畑で栽培されたC. equisetifoliaの根圏微生物群集の多様性は、内圏微生物群集の多様性よりもはるかに低いことが明らかになった。バイオインフォマティクス解析の結果、根圏微生物群集は根圏と内圏微生物群集の間で最も強い分化を示すことが明らかになった。また、根圏菌群集の分布は、樹齢の違いではなく、環境要因の影響を受けていることが明らかになった。

RESULTS: Our results indicate that the diversity of rhizosphere fungal microbiomes in field-grown C. equisetifolia is much lower than that of the endosphere microbiomes. Bioinformatic analysis showed that rhizocompartments produce the strongest differentiation of rhizosphere and endosphere communities. Notably, the distribution of rhizosphere fungi communities was significantly influenced by the environmental factors, not by forest ages.

結論:

本研究では、真菌類群集の多様性を決定するのは、森林の樹齢よりも、根粒コンパートメントや環境要因であることが示唆された。

CONCLUSIONS: The presented study suggests that the rhizocompartments and environmental factors, rather than forest ages, determine the diversities of fungal community.