サルモネラタイピーのT6SS免疫小島の同定

Identification of A Putative T6SS Immunity Islet in Salmonella Typhi.

• Luke A F Barretto
• Casey C Fowler

抄録

腸チフスは、主要な世界的な健康問題であり、人間に適応した細菌性病原体セロバータイピーによって引き起こされる全身感染症の結果である（。の基礎となる病理学的研究が行われています。Typhi感染症は、胃腸炎の一般的な原因である同じ種の広範な宿主範囲のセロバ-によって引き起こされる感染症とは大きく異なります。したがって、特定の .広範な宿主範囲の血清ウイルスにはない機能を付与するTyphiの遺伝的要因は、そのユニークな生物学への洞察を提供しています。ここでは、我々は未確認の14遺伝子の機能を探索するためにin-silicoのアプローチを使用しています。Typhiゲノム小島の機能を探索した。我々の結果は、この島は、それがTyphiとParatyphi A血清ウイルスによってコードされていた種に特異的であることを示したが、一般的に非Typhi血清ウイルスから欠落していた。比較ゲノミクスと配列解析ツールを用いて証拠を収集したところ、この島はVI型分泌系(T6SS)と接触依存性成長阻害(CDI)遺伝子から構成されており、その大部分はTyphiゲノムには存在しないエフェクターや毒素の活動から保護するオーファン免疫タンパク質をコードしているようであった。本研究では、この小島が.Typhiをヒトゲノム内の競合細菌から保護する免疫システムを表していることを提案する。腸内の競合する細菌から.Typhiを保護する免疫システムであることを提案する。

Typhoid fever is a major global health problem and is the result of systemic infections caused by the human-adapted bacterial pathogen serovar Typhi (. Typhi). The pathology underlying . Typhi infections significantly differ from infections caused by broad host range serovars of the same species, which are a common cause of gastroenteritis. Accordingly, identifying . Typhi genetic factors that impart functionality absent from broad host range serovars offers insights into its unique biology. Here, we used an in-silico approach to explore the function of an uncharacterized 14-gene . Typhi genomic islet. Our results indicated that this islet was specific to the species, where it was encoded by the Typhi and Paratyphi A serovars, but was generally absent from non-typhoidal serovars. Evidence was gathered using comparative genomics and sequence analysis tools, and indicated that this islet was comprised of Type VI secretion system (T6SS) and contact-dependent growth inhibition (CDI) genes, the majority of which appeared to encode orphan immunity proteins that protected against the activities of effectors and toxins absent from the . Typhi genome. We herein propose that this islet represents an immune system that protects . Typhi against competing bacteria within the human gut.