ハイスループットシーケンシングを用いた雲南のアピスセラナの腸内細菌叢の比較解析

Comparative analysis of the gut microbiota of Apis cerana in Yunnan using high-throughput sequencing.

• Zhi-Wen Luo
• Zhi-Xiang Dong
• Yi-Fei Chen
• Huan-Yuan Li
• Qi-He Tang
• Ji-Lian Li
• Jun Guo

抄録

腸内微生物は、宿主の病気や健康に重要な役割を果たしています。アジアのミツバチApis ceranaは、中国の農作物の重要な受粉者である。しかし、A. cerana、特に雲南省のA. ceranaの腸内微生物叢の構造と組成についての研究はまだほとんど行われていない。我々は、雲南省のA. ceranaの腸内微生物の種と組成を理解するために、ハイスループットシーケンシング技術を用いて、昆明、西双版納、孟子の50試料について16S rRNAシーケンシングを行った。その結果、3地域のA. ceranaの腸内微生物叢の構造と豊富さは、属レベルでも属レベルでも同じ傾向を示した。属レベルでは、プロテオバクテリア、ファーミキュテス、バクテロイデス、アクチノバクテリア、アシドバクテリアなどの種類が各地域のA. ceranaで高頻度に見られた。属レベルでは、Lactobacillus, Gilliamella, Snodgrassella, Apibacter, Candidatus Schmidhempeliaなどの種が各地のA. ceranaで高かった。西双版納の細菌群集の多様性は、その地理的環境と気候条件の特殊性から、属数レベルでは他の2つの地域に比べて有意に低く、約100属少ないことが明らかになった。結論として、本研究の結果は、雲南省におけるハチの腸内細菌叢の構成と構造を明らかにし、ハチの腸内細菌叢についての理解を深めるものである。

Gut microbes play an important role in host disease and health. The Asian honey bee Apis cerana is an important pollinator of agricultural crops in China. However, there are still few studies on the structure and composition of the microbiota in the intestine of A. cerana, especially A. cerana in Yunnan. To understand the species and composition of the microbiota in the intestine of A. cerana in Yunnan, we used high-throughput sequencing technology to carry out 16S rRNA sequencing on 50 samples from Kunming, Xishuangbanna and Mengzi. The results show that both from the phylum level and the genus level, the structure and abundance of the microbiota in the gut of A. cerana from the three regions tended to be the same. At the phylum level, the abundance of Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Acidobacteria and other species was high in A. cerana from different areas. At the genus level, the abundance of Lactobacillus, Gilliamella, Snodgrassella, Apibacter, Candidatus Schmidhempelia and other species was high in A. cerana from different areas. Due to its unique geographical environment and climatic conditions, at the genus level, the diversity of bacterial communities in Xishuangbanna was significantly lower than that in the other two regions, which was about 100 genera less. In conclusion, our results reveal the composition and structure of the intestinal microbiota of bees in Yunnan and deepen our understanding of the intestinal microbiota of bees.