海南省マングローブ土壌から分離された新規放線菌HNM0687株

sp. nov., a novel actinobacterium isolated from mangrove soil in Hainan.

• Yuhui Xie
• Shuangqing Zhou
• Yun Xu
• Wenqiang Wu
• Wei Xia
• Rongping Zhang
• Dongyi Huang
• Xiaolong Huang

抄録

中国・海南省のマングローブ土壌から新規放線菌HNM0687株を分離し，その多相分類について検討した。16S rRNA遺伝子配列解析の結果、HNM0687株はNBRC 16047（98.7"Zs_200A"%）、NBRC 16068（98.2"Zs_200A"%）、RS15-1S（97.9"Zs_200A"%）、NBRC 16320（97.7"Zs_200A"%）およびAMA 120（97.7"Zs_200A"%）と近縁であった。ゲノムベースの比較では、HNM0687株とその近縁株（74.4-78.3"Zs_200A"%）との間で、平均ヌクレオチド同一性の値に明確な違いが見られた。HNM0687株は全細胞加水分解物中に-ジアミノピメル酸、アラビノースおよびガラクトースを含有していた。ミコール酸が存在していた。HNM0687株のメナキノンはMK-9(H)およびMK-7(H)であった。本菌のリン脂質はジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルイノシトールから構成されていた。主な脂肪酸はＣ、Ｃ７／Ｃ６、Ｃ１０-メチル（ＴＢＳＡ）、Ｃ、Ｃ９であった。以上のことから，HNM0687株は本属の新種であることが示唆され，sp.型株は HNM0687 (=CCTCCAA 2019074 =KCTC 49383 ) である。

A novel actinobacterium, designated strain HNM0687, was isolated from mangrove soil samples collected from Hainan Province, PR China and its polyphasic taxonomy was studied. Based on the results of 16S rRNA gene sequence analysis, strain HNM0687 was closely related to NBRC 16047 (98.7 %), NBRC 16068 (98.2 %), RS15-1S (97.9 %), NBRC 16320 (97.7 %) and AMA 120 (97.7 %). Genome-based comparisons revealed a clear distinction in average nucleotide identity values between strain HNM0687 and its closely related strains (74.4-78.3 %). Strain HNM0687 contained -diaminopimelic acid, arabinose and galactose in whole-cell hydrolysates. Mycolic acid was present. The menaquinones of strain HNM0687 were MK-9(H) and MK-7(H). The phospholipids of the isolate were composed of diphosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine and phosphatidylinositol. The major fatty acids were C, C7/C6, C10-methyl (TBSA), C and C9. Based on its genotypic, chemotaxonomic and phenotypic characteristics, it is concluded that strain HNM0687 represents a novel species of the genus for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is HNM0687 (=CCTCC AA 2019074 =KCTC 49383 ).