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2013年から2019年までのニューヨーク州の蚊や哺乳類の症例から分離された東部馬蹄脳炎ウイルスと系統群の空間的・時間的拡大
Spatial and temporal expansions of Eastern equine encephalitis virus and phylogenetic groups isolated from mosquitoes and mammalian cases in New York State from 2013 to 2019.
PMID: 32672516 DOI: 10.1080/22221751.2020.1774426.
抄録
新興感染症である東部馬脳炎とその原因ウイルスの蚊へのサーベイランスは、2013年から2019年までニューヨーク州内で継続して行われた。地理的な範囲と連続した数の増加があり、4種の哺乳類で症例が、11種の蚊でウイルスが発生していました。ヤギとエミューで初の症例が報告されました。のウイルスが初めて検出されたことが報告された。系統群NY4のウイルスは、2013年に馬と6km、13日間隔で蚊から分離された。系統群NY4とNY5は、2013年に280km離れた2つの町で15日離れて発見されました。隣接する4つの郡内では、4つの郡がNY5、2つの郡がNY6、2つの郡がNY7、1つの郡がNY5、NY6、NY7を持つ重複パターンがあり、オイラー図に還元可能であった。系統群NY5のウイルスは、ニューヨーク州の11kmの範囲内で発見され、1,398km離れたフロリダ州で発見されたFL4と関連していた。これは、系統群がフロリダで発生した後、2013年と2014年の連続した年に渡り鳥によってニューヨーク州の特定の場所に移動したことと一致していた。
Surveillance for the emerging infectious disease Eastern equine encephalitis, and its causative virus in mosquitoes, continued within New York State from 2013 to 2019. There were increases in geographic area and number of consecutive years, with cases in four mammalian species, and virus in 11 mosquito species. The first cases in a goat and in an emu were reported. The first detection of virus in was reported. Virus in phylogenetic group NY4 was isolated from a horse and from mosquitoes 6 kilometers and 13 days apart in 2013. Phylogenetic groups NY4 and NY5 were found 15 days apart in two towns 280 kilometers distant in 2013. Within four adjacent counties there was a pattern of overlap, where four had NY5, two adjacent counties had NY6, two adjacent counties had NY7, and one county had NY5, NY6, and NY7, reducible to a Euler diagram. Virus in phylogenetic group NY5, found within an 11-kilometer wide area in New York State, was related to FL4 found in Florida 1,398 kilometers distant. This was consistent with a phylogenetic group originating in Florida, then being moved to a specific location in New York State, by migratory birds in consecutive years 2013 and 2014.