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TCR-seqは遠隔転移性甲状腺腫瘍と非遠隔転移性甲状腺腫瘍の異なるレパートリーを同定する
TCR-seq identifies distinct repertoires of distant metastatic and non-distant metastatic thyroid tumors.
PMID: 32674137 DOI: 10.1210/clinem/dgaa452.
抄録
文部科学省:
遠隔転移を伴う甲状腺悪性腫瘍は予後不良の原因となる。遠隔転移の早期発見は臨床的に非常に重要である。
CONTEXT: Malignant thyroid tumor with distant metastasis is associated with poor outcome. Early detection of the distant metastasis is of great clinical importance.
目的:
甲状腺腫瘍浸潤T細胞は、転移をモニタリングするためのバイオマーカーとしての役割を果たすことができる。
OBJECTIVE: Thyroid tumor infiltrated T cell can be served as a biomarker for monitoring metastasis.
デザイン:
2012年から2018年の間に収集された患者の臨床サンプルを対象に、TCR-seqを用いてレトロスペクティブ解析を行った。
DESIGN: Retrospective analysis was performed of clinical samples from patients collected between 2012 to 2018, using TCR-seq for clinical exploration.
設定:
浙江省癌病院。
SETTING: Zhejiang Cancer Hospital.
PATIENTS(患者):
PTC(明らかな転移状態)の68例と良性結節の21例が登録された。すべての患者は手術前に治療を受けていなかった。
PATIENTS: 68 patients with PTC (distinct metastatic status) and 21 patients with benign nodules were enrolled. All patients had not received any treatment before surgery.
主な成果測定:
各患者のTCRβ CDR3の特徴をハイスループットシーケンシングにより決定した。
MAIN OUTCOME MEASURE: The characteristics of TCRβ CDR3 for each patient were determined by High-throughput sequencing.
結果:
悪性腫瘍のTCRβ多様性は、血液サンプルと腫瘍サンプルの両方で良性結節よりも有意に高かった(Shannon index, blood, P < 0.01; tumor, P < 0.001)。遠隔転移性または浸潤性を有する悪性腫瘍は、非転移性(シャノン指数、P<0.01)または非浸潤性(シャノン指数、P<0.01)の悪性腫瘍よりも低いTCRβ多様性を示した。Morisita-Horn類似度指数の分析から、遠隔転移患者では腫瘍と血液の間に有意なTCRβレパートリー類似性が認められた(非転移との比較、P<0.05)。臨床病理学的状態の異なる患者間でのCDR3の不一致に応じて、遠隔転移患者を識別するための分類器を構築した。その結果,CDR3のクローンタイプが重複している場合には,AUC値83.8%という有望な結果が得られた.
RESULTS: The TCRβ diversity of malignant tumors is significantly higher than benign nodules in both blood and tumor samples (Shannon index, blood, P < 0.01; tumor, P < 0.001). The malignant tumors with distant metastasis or invasiveness showed lower TCRβ diversity than non-metastasis (Shannon index, P < 0.01) or non-invasive (Shannon index, P < 0.01) malignant tumors. Analysis of the Morisita-Horn similarity index indicated that the significant TCRβ repertoires similarity between tumor and blood in distant metastatic patients (Comparison with Non-metastasis, P < 0.05). According to the discrepancy of the CDR3 among patients with different clinicopathological status, the classifier was constructed to discriminate distant metastatic individuals. The promising AUC value 83.8% was obtained with the number of overlapping CDR3 clonotypes.
結論:
TCR-seqの利用可能性と信頼性は、PTC患者の遠隔転移をモニタリングするために、これらの本質的な特性を臨床に応用することを可能にしている。
CONCLUSION: The availability and reliability of TCR-seq render it prospective to translate these intrinsic attributes into clinical practice for monitoring distant metastasis in PTC patients.
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