非加齢白菜におけるコールドショックプロテイン3（BcCSP3）の同定と発現解析

Identification and Expression Analysis of Cold Shock Protein 3 (BcCSP3) in Non-Heading Chinese Cabbage ( ssp. ).

• Feiyi Huang
• Jin Wang
• Weike Duan
• Xilin Hou

抄録

本研究では、非脱皮白菜から寒冷関連タンパク質であるコールドショックプロテイン3（BcCSP3）を単離した。BcCSP3は205アミノ酸（aa）、618塩基対（bp）のオープンリーディングフレーム（ORF）をコードすることができる。多重配列アラインメントと系統樹解析により、BcCSP3はN末端にコールドショックドメインを含み、AtCSP2と非常に類似しており、その近親性は最近であることが示された。リアルタイム定量ポリメラーゼ連鎖反応(RT-qPCR)により、茎や葉の発現レベルが根の発現レベルよりも高いことが示された。また、他のストレス処理と比較して、低温ストレス下での発現量の変化が最も顕著であった。また、核と細胞質に融合タンパク質が局在していた。これらの結果から、BcCSP3は、非脱根性白菜の寒冷ストレスに対する応答に重要な役割を果たしている可能性が示唆された。本研究は、非脱皮ハクサイにおける他の遺伝子の同定や発現解析の参考となる可能性がある。

A cold-related protein, cold shock protein 3 (BcCSP3), was isolated from non-heading Chinese cabbage in this study. BcCSP3 can encode 205 amino acids (aa) with an open reading frame (ORF) of 618 base pairs (bp). Multiple sequence alignment and phylogenetic tree analyses showed that BcCSP3 contains an N-terminal cold shock domain and is highly similar to AtCSP2, their kinship is recent. Real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) showed that the expression level of in stems and leaves is higher than that in roots. Compared with other stress treatments, the change in expression level was most pronounced under cold stress. In addition, a fusion protein was localized to the nucleus and cytoplasm. These results indicated that BcCSP3 may play an important role in response to cold stress in non-heading Chinese cabbage. This work may provide a reference for the identification and expression analysis of other genes in non-heading Chinese cabbage.