アジアシトラスサイリド（Hemiptera: Psyllidae）のトランスクリプトームの発生ステージを越えたデノボアセンブリー

De Novo Assembly of the Asian Citrus Psyllid (Hemiptera: Psyllidae) Transcriptome across Developmental Stages.

• Chunxiao Yang
• Da Ou
• Wei Guo
• Jing Lü
• Changfei Guo
• Baoli Qiu
• Huipeng Pan

抄録

アジアシトラスサイリド桑山は、黄龍ビンの原因菌であるLiberibacter asiaticusを媒介することから、柑橘類の重要な経済害虫である。本研究では、RNA-seq法を用いて新規遺伝子を同定し、発生過程におけるトランスクリプトームを高分解能で解析した。本研究では、卵、5齢児、雄雌成虫を含む8つの発生段階のトランスクリプトームをシークエンスした。その結果、1億1500万個のクリーンリードが得られ、平均長925.65bp、N50長1733bpの35万4,726個のユニゲノムが得られた。これらの遺伝子を機能的にアノテーションするために、Cluster of Orthologous Groups、Gene Ontology、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomesの解析を行った。また、発現解析により、発生ステージに特異的な発現パターンが明らかになった。さらに、2 つのトレハラーゼ遺伝子は、成人では他のステージに比べて発現が低いことが特徴的であった。また、RNA干渉（RNAi）を介したトレハラーゼ遺伝子の発現抑制は、死亡率を有意に高める結果となった。今回の研究により、トレハラーゼ遺伝子のゲノム情報がより豊かになった。重要なことは、これらのデータは、現在利用可能な最も包括的なトランスクリプトームリソースであり、この悪名高い害虫の機能的ゲノミクス研究を促進するものであるということである。

Asian citrus psyllid Kuwayama is an important economic pest of citrus, as it transmits Liberibacter asiaticus, the causative agent of huanglongbing. In this study, we used RNA-seq to identify novel genes and provide the first high-resolution view of the of transcriptome throughout development. The transcriptomes of during eight developmental stages, including the egg, five instars, and male and female adults were sequenced. In total, 115 million clean reads were obtained and assembled into 354,726 unigenes with an average length of 925.65 bp and an N50 length of 1733 bp. Clusters of Orthologous Groups, Gene Ontology, and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analyses were conducted to functionally annotate the genes. Differential expression analysis highlighted developmental stage-specific expression patterns. Furthermore, two trehalase genes were characterized with lower expression in adults compared to that in the other stages. The RNA interference (RNAi)-mediated suppression of the two trehalase genes resulted in significantly high mortality. This study enriched the genomic information regarding . Importantly, these data represent the most comprehensive transcriptomic resource currently available for and will facilitate functional genomics studies of this notorious pest.