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Cobetia marinaの細胞内代謝物に及ぼすオゾンストレスの影響
Effect of ozone stress on the intracellular metabolites from Cobetia marina.
PMID: 32676676 DOI: 10.1007/s00216-020-02810-6.
抄録
海洋バイオファウリングのモデル菌であるCobetia marinaの代謝非標的分析には、無極性×中極性カラムセットを用いたGCxGC-MSシステムを用いた。酸化ストレス下での細胞内代謝状態の変化を調べるために、C. marinaをオゾンで処理した。本研究では、酸化ストレス下での細胞内代謝状態の変化を調べるために、オゾン処理量が細胞に致死的な影響を与えないことを保証するために、最小阻害濃度試験を実施した。本研究では、NIST データベースに基づいて代謝物を同定するために非標的分析を実施した。その結果、35 種類の潜在的な代謝物を含む 170 種類以上のシグナルが、通常の生活条件下で検出されました。オゾン処理したサンプルと非処理サンプルを比較することで、等高線プロットで観察されたシグナルの傾向を記述するために5つの化合物を選択しました。オレイン酸はオゾン量の増加に伴ってわずかに増加した。一方、アミノ酸のL-プロリンのような他の代謝物は、オゾン処理後にその量が減少し、オゾン量を増加させるとより顕著になることがわかった。このように、本研究はC. marinaのこのような環境ストレス条件におけるアップ／ダウンレギュレーション因子の探索にヒントを与える可能性がある。グラフィカルアブストラクト
A GCxGC-MS system was employed with a non-polar × mid-polar column set for the metabolic non-target analysis of Cobetia marina, the model bacteria for marine biofouling. C. marina was treated with ozone to investigate the intracellular metabolic state change under oxidative stress. A minimal inhibitory concentration test was involved to guarantee that the applied ozone dosages were not lethal for the cells. In this study, non-target analyses were performed to identify the metabolites according to the NIST database. As a result, over 170 signals were detected under normal living conditions including 35 potential metabolites. By the comparison of ozone-treated and non-treated samples, five compounds were selected to describe observed trends of signals in the contour plots. Oleic acid exhibited a slight growth by increasing ozone dosage. In contrast, other metabolites such as the amino acid L-proline showed less abundance after ozone treatment, which was more evident once ozone dosage was raised. Thus, this work could provide a hint for searching for up/downregulating factors in such environmental stress conditions for C. marina. Graphical abstract.