中国南部の家畜化されたウズラ鴨（Jing-Xi）から分離された新規ガチョウパルボウイルスにおける組換えの同定

Identification of recombination in novel goose parvovirus isolated from domesticated Jing-Xi partridge ducks in South China.

• Wen-Jun Liu
• You-Tian Yang
• Hai-Yin Zou
• Shi-Jian Chen
• Chen Yang
• Yun-Bo Tian
• Yun-Mao Huang

抄録

中国では2015年以降、新型ガチョウパルボウイルス（NGPV）による短嘴矮小症症候群（SBDS）のアウトブレイクが発生している。この急速に蔓延する感染症は、特にアヒルに影響を与え、高い罹患率と低い死亡率を示し、莫大な経済的損失をもたらしている。本研究では、中国南部のSBDSを有するJing-Xiウズラ鴨から分離されたNGPVの進化を解析した。NGPV株GDQY1802およびGDSG1901の完全ゲノム配列は他のGPV/NGPVおよびMuscovy duck parvovirus（MDPV）株と相同性があった。系統解析の結果、中国大陸から分離されたNGPVは、台湾の82-0321v株のGPVに関連していることがわかった。中国から初めて分離された82-0321v株およびSDLC01株とは対照的に，この2つの分離株では，反転末端リピート（ITR）領域に欠失は認められなかった．また、これらの分離株では、GPV生ワクチン株82-0321vと比較して、複製タンパク質の24アミノ酸部位が異なり、12部位がNGPV全体で特異的であった。また，これらの分離株ではキャプシドタンパク質の17アミノ酸部位が82-0321vと異なり，そのうち2部位はMDPVと同じであった．組換え解析の結果、GDSG1901とGDQY1802の主要な親株はNGPV-GD株とNGPV-Hun18株、マイナーな親株はそれぞれ古典的なGPV 06-0329株とGPV LH株であることが判明した。GDQY1802およびGDSG1901は、家畜化されたウズラ鴨から分離された組換え型GPV関連パルボウイルスである。組換えは、ＮＧＰＶの進化において明らかであり、そのようなものとして、ＮＧＰＶのための生きた減衰ワクチンの使用は、さらなる研究が必要である。

Outbreaks of short beak and dwarfism syndrome (SBDS), caused by a novel goose parvovirus (NGPV), have occurred in China since 2015. This rapidly spreading, infectious disease affects ducks in particular, with a high morbidity and low mortality rate, causing huge economic losses. This study analyzed the evolution of NGPV isolated from Jing-Xi partridge duck with SBDS in South China. Complete genome sequences of the NGPV strains GDQY1802 and GDSG1901 were homologous with other GPV/NGPV and Muscovy duck parvovirus (MDPV) strains. Phylogenetic analysis showed that the NGPV isolated from mainland China was related to the Taiwan 82-0321v strain of GPV. In contrast to 82-0321v and the SDLC01 strain, which was first isolated from China, the two isolates showed no deletions in the inverted terminal repeat (ITR) region. Further, in these isolates, 24 amino acid sites of the replication protein were different compared to that of GPV live vaccine strain 82-0321v, and 12 sites were unique across all NGPV isolates. These isolates also showed differences in 17 amino acid sites of the capsid protein from that of 82-0321v, two of which were the same as those in MDPV. Recombination analysis identified the major parents of GDSG1901 and GDQY1802 as the NGPV-GD and NGPV-Hun18 strains, and the minor parents as the classical GPV 06-0329 and GPV LH strains, respectively. GDQY1802 and GDSG1901 are recombinant GPV-related parvovirus isolated from domesticated partridge duck. Recombination is evident in the evolution of NGPV, and as such, the use of live attenuated vaccines for NGPV requires further study.