健康と病気におけるヒトT細胞受容体レパートリーとオミックス統合の可能性

The human T cell receptor repertoire in health and disease and potential for omics integration.

• Thomas S Watkins
• John J Miles

抄録

適応免疫システムは、6億年前に冷血魚の中で誕生した。数え切れないほどの世代を経て、我々の先祖はT細胞受容体（TCR）の機能を調整してきた。TCRシステムは、おそらく科学的に知られている中で最も複雑なものです。TCRは、私たちの資源を消費するように見える病原体や癌の超可変性と戦うために、超可変性を進化させた。このレビューでは、ヒトTCRの遺伝学とアーキテクチャについて説明し、非常に古いドグマを反証してきた過去数年間で驚くべき新発見を強調しています。TCRシーケンスデータの標準化については、ビッグデータ・バイオインフォマティクスと予測分析のための準備として議論されています。疾患における新たなTCRシグネチャーがカタログ化され、TCR次世代シークエンシング(NGS)によって発見され、基礎分野と応用分野で行われるべき残りの作業について議論します。最後に、TCR NGSを現在のオミックスプラットフォームと組み合わせることで、TCRの生物学をより深く理解し、臨床現場での使用を促進するためのオプションについて議論する。

The adaptive immune system arose 600 million years ago in a cold-blooded fish. Over countless generations, our antecedents' tunned the function of the T cell receptor (TCR). The TCR system is arguably the most complex known to science. The TCR evolved hyper-variability to fight the hyper-variability of pathogens and cancers that look to consume our resources. This review describes the genetics and architecture of the human TCR and highlights surprising new discoveries over the past years that have disproved very old dogmas. The the standardisation of TCR sequencing data is discussed in preparation for big data bioinformatics and predictive analytic analysis. New TCR signatures in disease are catalogued, discovered by TCR next generation sequencing (NGS) and discuss remaining work to be done in the basic and applied fields. Finally options of combining TCR NGS with current omics platforms are discussed for a deeper understanding of TCR biology and use in clinical settings.

This article is protected by copyright. All rights reserved.