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J. Hepatol..2020 Jul;S0168-8278(20)30456-6. doi: 10.1016/j.jhep.2020.06.045.Epub 2020-07-14.

非硬直性隔壁静脈血栓症の診断における次世代シーケンシング

Next generation sequencing in the diagnosis of non-cirrhotic splanchnic vein thrombosis.

  • Marta Magaz
  • Alberto Alvarez-Larrán
  • Dolors Colomer
  • Mónica López-Guerra
  • M Ángeles García-Criado
  • Gabriel Mezzano
  • Ernest Belmonte
  • Pol Olivas
  • Guillem Soy
  • Francisco Cervantes
  • Anna Darnell
  • José Ferrusquía-Acosta
  • Anna Baiges
  • Fanny Turon
  • Virginia Hernández-Gea
  • Juan Carlos García-Pagán
PMID: 32679300 DOI: 10.1016/j.jhep.2020.06.045.

抄録

骨髄増殖性新生物(MPN)は、非腫瘍性非結節性隔膜静脈血栓症(NC-SVT)の最も頻度の高い原因である。MPNの診断は、血球数の変化、骨髄組織検査、および特定の遺伝子変異の検出に基づいて行われる。次世代シークエンシング(NGS)は、骨髄クローン病理に関与する複数の遺伝子を同時に評価することを可能にしている。本研究の目的は、NC-SVTの病因におけるNGSの潜在的な役割を評価することであった。

BACKGROUND & AIMS: Myeloproliferative neoplasms (MPN) are the most frequent cause of non-tumoral non-cirrhotic splanchnic vein thrombosis (NC-SVT). Diagnosis of MPN is based on blood cell count alterations, bone marrow histology and detection of specific gene mutations. Next generation sequencing (NGS) allows the simultaneous evaluation of multiple genes implicated in myeloid clonal pathology. The aim of this study was to evaluate the potential role of NGS in the etiology of NC-SVT.

方法:

80人の患者(特発性または排他的局所因子(Idiop/loc-NC-SVT)を有する75人と、古典的手法によるJAK2(V617Fおよびエクソン12)、CALRおよびMPL変異陰性のMPNおよびNC-SVT(SVT-MPN)を有する5人)からのDNAサンプルをNGSで解析した。JAK2、CALR、MPL遺伝子とは異なる骨髄障害に関与する変異は、High Molecular Risk(HMR)-variantsまたはVariants of Unknown Significance(VUS)に分類された。

METHODS: DNA samples from 80 patients, (75 with idiopathic or exclusively local factor (Idiop/loc-NC-SVT) and 5 with MPN and NC-SVT (SVT-MPN) negative for JAK2 (V617F and exon 12), CALR and MPL mutations by classic techniques) were analyzed by NGS. Mutations involved in myeloid disorders different from JAK2, CALR and MPL genes were categorized as High Molecular Risk (HMR)-variants or Variants of Unknown Significance (VUS).

結果:

トリプルネガティブSVT-MPNの2/5例(40%)において、JAK2のエクソン12の変異が同定された。JAK2-エクソン12の変異は、1/75のidiop/loc-NC-SVT患者においても同定された。さらに、残りの idiop/loc-NC-SVT 患者の 28/74(37.8%)には、少なくとも 1 つの HMR 変異が認められた。idiop/loc-NC-SVT患者のうち62人は長期抗凝固療法を受けておらず、そのうち5人(8.1%)は再発NC-SVTを有していた。この累積発生率は、HMRバリアントを有する患者の方がそうでない患者よりも有意に高かった。

RESULTS: In 2/5 triple-negative SVT-MPN cases (40%) a mutation in exon 12 of JAK2 was identified. JAK2-exon 12 mutation was also identified in 1/75 patients with idiop/loc-NC-SVT. Moreover, 28/74 (37.8%) of the remaining idiop/loc-NC-SVT had at least one HMR variant. Sixty-two patients with idiop/loc-NC-SVT were not receiving long-term anticoagulation and five of them (8.1%) had recurrent NC-SVT. This cumulative incidence was significantly higher in patients with HMR-variants than in those without.

結論:

NGSは、従来の手法では検出されなかったJAK2-exon12変異を同定した。さらに、NGSはidiop/loc-NC-SVT患者の約3分の1にHMR変異を検出した。これらの患者ではスプラングニック再血栓症のリスクが高いようである。NGSはNC-SVTにおいて有用な診断ツールとなる可能性がある。

CONCLUSIONS: NGS identified JAK2-exon12 mutations not previously detected by conventional techniques. In addition, NGS detected HMR-variants in approximately one third of patients with idiop/loc-NC-SVT. These patients seem to have a higher risk of splanchnic rethrombosis. NGS might be a useful diagnostic tool in NC-SVT.

Copyright © 2020. Published by Elsevier B.V.