ネフロン前駆細胞における核酸（LNA）ギャップマーによる核内lncRNAのノックダウン

Knockdown of Nuclear lncRNAs by Locked Nucleic Acid (LNA) Gapmers in Nephron Progenitor Cells.

• Masaki Nishikawa
• Norimoto Yanagawa

抄録

近年、長いノンコーディングRNA（lncRNA）の役割についての理解が進んでいるにもかかわらず、大部分のlncRNAの機能はまだ十分に理解されていません。lncRNAの機能を明らかにするためには、ノックダウン研究が不可欠です。しかし、RNA干渉（RNAi）のような従来のmRNAのサイレンシング法では、lncRNAの局在とRNAiの機械のミスマッチが原因で、lncRNAに対して効率的ではない可能性があります。このような制限を回避するために、最近、ロックされた核酸（LNA）ギャップマーという新しい技術が開発されました。これは、核と細胞質の両方に均一に分布するRNase Hを利用したもので、細胞内での局在に関係なく、目的のlncRNAをより一貫してノックダウンすることが期待されている。本章では、マウス腎前駆細胞を例に、LNAガプマーによるlncRNAの消音のコツを解説します。

Despite recent advance in our understanding on the role of long noncoding RNAs (lncRNAs), the function of the vast majority of lncRNAs remains poorly understood. To characterize the function of lncRNAs, knockdown studies are essential. However, the conventional silencing methods for mRNA, such as RNA interference (RNAi), may not be as efficient against lncRNAs, partly due to the mismatch of the localization of lncRNAs and RNAi machinery. To circumvent such limitation, a new technique has recently been developed, i.e., locked nucleic acid (LNA) gapmers. This system utilizes RNase H that distributes evenly in both nucleus and cytoplasm and is expected to knock down lncRNAs of interest more consistently regardless of their localization in the cell. In this chapter, we describe the procedure with tips to silence lncRNAs by LNA gapmers, by using mouse nephron progenitor cells as an example.