定量的プロテオミクスを用いたフラビウイルス-宿主相互作用の解読

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Curr. Opin. Immunol..2020 Jul;66:90-97. S0952-7915(20)30065-0. doi: 10.1016/j.coi.2020.06.002.Epub 2020-07-15.

定量的プロテオミクスを用いたフラビウイルス-宿主相互作用の解読

Deciphering flavivirus-host interactions using quantitative proteomics.

Minghua Li
Holly Ramage
Sara Cherry

PMID: 32682290 DOI: 10.1016/j.coi.2020.06.002.

抄録

フラビウイルスは、毎年何千人もの死者を出す世界的な疫病を引き起こす重要なヒト病原体の一群である。フラビウイルスは、小型のエンベロープ型のポジティブセンス一本鎖RNAウイルスであり、細胞内病原体であり、生産的な複製のために宿主細胞の機械に大きく依存しています。プロテオミクスアプローチは、ウイルスが宿主タンパク質と相互作用し、感染を促進するために細胞プロセスを操作するメカニズムを研究するための、ますます強力なツールとなってきている。ここでは、フラビウイルスと宿主細胞の間の複雑な相互作用の理解を深めるために、定量的プロテオミクス技術を用いた最近の進歩をレビューする。また、フラビウイルスがどのようにタンパク質-タンパク質相互作用、タンパク質-RNA相互作用、タンパク質の豊富さ、翻訳後修飾に影響を与え、ウイルス感染を制御するのかについての新たな知見を述べている。

Flaviviruses are a group of important emerging and re-emerging human pathogens that cause worldwide epidemics with thousands of deaths annually. Flaviviruses are small, enveloped, positive-sense, single-stranded RNA viruses that are obligate intracellular pathogens, relying heavily on host cell machinery for productive replication. Proteomic approaches have become an increasingly powerful tool to investigate the mechanisms by which viruses interact with host proteins and manipulate cellular processes to promote infection. Here, we review recent advances in employing quantitative proteomics techniques to improve our understanding of the complex interplay between flaviviruses and host cells. We describe new findings on our understanding of how flaviviruses impact protein-protein interactions, protein-RNA interactions, protein abundance, and post-translational modifications to modulate viral infection.