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SARS-CoV-2のタンパク質構造におけるT細胞およびB細胞エピトープの免疫学的およびバイオインフォマティクス的同定：システマティックレビュー
Immune and bioinformatics identification of T cell and B cell epitopes in the protein structure of SARS-CoV-2: A systematic review.
PMID: 32683296 DOI: 10.1016/j.intimp.2020.106738.
抄録
2020年の初めには、新しいコロナウイルスである重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）によるCOVID-19アウトブレイクが出現しました。現在、この感染性ウイルスに対するワクチンや承認された治療法はないため、効率的なワクチンの発明は確かに高い優先度を持っています。いくつかの研究では、2019-nCoVエンベロープタンパク質を標的として使用するT細胞エピトープベースのペプチドワクチンを設計するための潜在的なペプチドを決定するために、免疫インフォマティクスアプローチと比較ゲノムアプローチの組み合わせを容易にするために、いくつかの技術を採用している。SARS-CoV2タンパク質の基礎免疫原性内にある生体免疫学的なSARS-CoV2由来のB細胞およびT細胞エピトープをスクリーニングすることにより、高い抗原性を有し、かつアレルゲン性や毒性のないスパイク(S)およびヌクレオカプシド(N)タンパク質から推定されるB細胞およびT細胞エピトープのセットを提示した。我々の知見は、SARS-CoV-2ウイルスに対するペプチドワクチン開発のための潜在的なターゲットとして導入可能なエピトープのスクリーニングセットを提供する。
The beginning of 2020 was marked as the emergence of a COVID-19 outbreak caused by a new coronavirus, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Currently, there is no vaccine or approved treatment for this infectious virus so the invention of an efficient vaccine is certainly a high priority. Some studies have employed several techniques to facilitate the combination of the immunoinformatics approach and comparative genomic approach in order to determine the potential peptides for designing the T-cell epitope-based peptide vaccine using the 2019-nCoV envelope protein as a target. Via screening the bioimmunoinformatic SARS-CoV2 derived B-cell and T-cell epitopes within the basic immunogenic of SARS-CoV2 proteins, we presented a set of inferred B-cell and T-cell epitopes from the spike (S) and nucleocapsid (N) proteins with high antigenicity and without allergenic property or toxic effects. Our findings provide a screened set of epitopes that can be introduced as potential targets for developing peptide vaccines against the SARS-CoV-2 virus.
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