下顎骨第三大臼歯の歯根膜組織において、超保存領域から転写される非コードRNA（T-UCR）の発現が異なっている

Non-coding RNAs transcribed from ultra-conserved regions (T-UCRs) are differentially expressed in dental follicle tissues of impacted mandibular third molars.

抄録

はじめに:

転写型超保存領域（T-UCR）は、ヒトゲノムの超保存領域（UCR）から転写される新しいクラスの長鎖非コードRNA分子である。T-UCRは、ヒト、ラット、マウスのゲノムに極めてよく保存されている。UCRを含むゲノム領域を欠失させたマウスは、明らかな表現型なしに発育することから、T-UCRが発生プロセスに関与していることが示唆されている。また、歯根膜組織は、タンパク質コード遺伝子やノンコーディングRNAの制御を伴う様々な細胞変化を示すことが分かってきている。そこで、本研究では、歯根膜の超保存領域から転写される非コードRNA分子の臨床的意義と異なる発現シグネチャーを明らかにすることを主目的とした。

INTRODUCTION: Transcribed ultra-conserved regions (T-UCRs) are a new class of long non-coding RNA molecules transcribed from ultra-conserved regions (UCRs) of the human genome. T-UCRs are extremely conserved in the human, rat, and mouse genomes. Deletions of genomic areas containing UCRs resulted in live mice that developed without discernible phenotypes, implying that T-UCRs are involved in developmental processes. In addition, there is increasing evidence that dental follicle tissues exhibit various cellular alterations involving deregulation of protein-coding genes and non-coding RNAs. Accordingly, the main objective of the present study was to determine the clinical significance and distinct expression signatures of non-coding RNA molecules transcribed from ultra-conserved regions in dental follicle samples.

材料および方法:

2021年3月から2022年12月までに、38位と48位の下顎第三大臼歯の埋伏抜歯を適応として口腔顎顔面外科の診療所に紹介された患者計42名を研究に登録した。T-UCRの発現量の解析には、リアルタイム定量逆転写PCR法を使用した。

MATERIALS AND METHODS: From March 2021 to December 2022, a total 42 patients who referred to clinic of oral and maxillofacial surgery department with the indications of impacted mandibular third molar extraction from 38 and 48 positions were enrolled for the study. For the analysis of T-UCR expression levels, real-time quantitative reverse transcription PCR method was used.

結果:

本研究の結果、T-UCRは下顎第三大臼歯の歯根膜組織で特異的に発現していることが示された。また，uc.38，uc.112，uc.338の発現が下顎第三大臼歯の歯根膜で有意に増加しており，これらの分子の臨床的意義が示唆された．また，T-UCRの発現は，人口統計学的因子による差は認められなかった．

RESULTS: Findings of the present study indicated that T-UCRs are distinctly expressed in dental follicle tissues of impacted mandibular third molars. The expression of uc.38, uc.112, and uc.338 was found to be significantly increased in the dental follicles of impacted mandibular third molars, indicating a clinical significance of these molecules. In addition, no differences in T-UCR expression were found as a function of demographic factors.

結論:

下顎骨転位症の歯根組織では，uc.38，uc.112，uc.338 などの転写された超保存配列が著しく制御されており，下顎骨転位症の歯根組織が獲得する分子変化に関与している可能性が示唆された．

CONCLUSIONS: Collectively, transcribed ultra-conserved elements, such as uc.38, uc.112, and uc.338, are considerably deregulated in the dental follicle tissues of impacted mandibular third molars and might be responsible for the molecular changes acquired by dental follicle tissues of impacted mandibular third molars.