双子とその家族に寄生するspp.分離株の遺伝的多様性

Genetic Diversity of spp. Isolates Colonizing Twins and Their Family Members.

抄録

遺伝学的手法により、生物種を研究するための様々な選択肢が用意されています。双子、特に一卵性双生児とその家族は、それらの微生物を研究するのに適した被験者となりうる。問題は、酵母菌叢が個人の中でどの程度特異的であるかということである。本研究では、健康な人の体のさまざまな部位から分離した常在菌の菌株の関連性を分析し、分離菌株の遺伝子型間の相関を比較することを目的としました。63名の双子とその家族（＝25名）から、口腔、肛門、趾間、へそから酵母を分離した。種同定後、（＝139）、（＝39）、（＝25）、（＝11）、（＝9）の分離株をランダム増幅多型DNAポリメラーゼ連鎖反応（RAPD-PCR）最適化法を用いて解析した。菌株間の類似性はダイス（Sab）係数に基づいて計算され、デンドログラムとしてグラフ表示される。クラスター分析により、以下の関連性が区別された：13の遺伝子型と3つのユニーク（Un）パターン間；10の遺伝子型と4つのUnパターン間；3の遺伝子型と1のUnパターン間；および分離株間の3遺伝子型。家族から分離された菌株に同一，類似，あるいは両方の遺伝子型が存在することは，同一人物や個人間で酵母が感染していることを示す．同一人物およびその家族から分離された菌株の遺伝子型は， , , , の遺伝子型間の類似性が， , , の遺伝子型間の類似性よりも顕著であった．一卵性双生児から分離されたspp.株とその親族から得られた株との間の遺伝的類似性の程度に差はなかった。

A wide range of options for studying species are available through genetic methods. Twins, particularly monozygotic ones and their families may be fitting subjects for studying those microorganisms. The question is: How specific can yeast flora be in an individual? The study aimed to analyze the strain relatedness among commensal yeasts isolated from various parts of the bodies of healthy people and to compare correlations between the genotypes of the isolates. Yeasts were isolated from 63 twins and their family members ( = 25) from the oral cavity, anus, interdigital space and navel. After species identification, ( = 139), ( = 39), ( = 25), ( = 11) and ( = 9) isolates were analyzed using the random amplified polymorphic DNA polymerase chain reaction (RAPD-PCR) optimization method. The similarities between the strains were calculated based on the Dice (Sab) coefficient and are displayed graphically as dendrograms. Using cluster analysis, the following relatedness was distinguished: 13 genotypes and three unique (Un) patterns among ; 10 genotypes and four Un patterns among ; three genotypes and one Un pattern among and ; and three genotypes among isolates. The presence of identical, similar or both genotypes among the strains isolated from family members shows the transmission of yeasts between ontocenoses in the same person and between individuals. The similarity between the genotypes of , , and was more remarkable than between the genotypes of in the strains isolated from ontocenoses of the same individual and their family members. The degrees of genetic similarity between spp. strains isolated from monozygotic twins and those obtained from their relatives did not differ.