ヒト髄芽腫におけるENTPD1（CD39）とNT5E（CD73）の発現：in silico解析

ENTPD1 (CD39) and NT5E (CD73) expression in human medulloblastoma: an in silico analysis.

抄録

髄芽腫は小児集団において最も一般的な悪性腫瘍である。髄芽腫の分類には、組織学的特徴に加えて、主要な分子学的変異が組み込まれている。プリン作動性シグナル伝達経路の酵素であるCD39（ENTPD1としても知られる）とCD73（NT5Eとしても知られる）は相乗的に作用して細胞外アデノシンを生成し、免疫抑制性の腫瘍微小環境を作り出す。本研究では、Cavalliコホート（n=763）から得られた髄芽腫患者サンプルのトランスクリプトームデータセットを用いて、これらの遺伝子のmRNA発現を調べた。生存期間分布は、中央値カットオフとログランク統計（p≦0.05）を用いたKaplan-Meier法に従って推定した。非WNTおよび非SHH髄芽腫グループ4（n=264）では、ENTPD1およびNT5Eの高発現が全生存期間の短縮と有意に関連していた（p=2.7e-04; p=2.6e-03）。SHH活性化群（n=172）では、ENTPD1の高発現は全生存率の低下（p=7.8e-03）と有意に関連していたが、NT5Eの高発現は全生存率の延長（p=0.017）と有意に関連していた。WNT群（n=63）では、ENTPD1とNT5Eの発現は全生存期間と有意な相関はなかった（p=0.212; p=0.101）。非WNTおよび非SHH髄芽腫グループ3（n=113）では、ENTPD1の高発現は生存期間の延長と有意に関連していたが（p=0.034）、NT5Eの発現は患者の生存期間と有意に関連していなかった（p=0.124）。このin silico解析は、ENTPD1（CD39）とNT5E（CD73）が、非WNTおよび非SHHグループ4における原発性髄芽腫の予後マーカーおよび治療標的の可能性があることを示している。

Medulloblastoma is the most common malignant tumor in the pediatric population. Its classification has incorporated key molecular variations alongside histological characterization. CD39 (also known as ENTPD1) and CD73 (also known as NT5E), enzymes of the purinergic signaling pathway, act in synergy to generate extracellular adenosine, creating an immunosuppressive tumor microenvironment. Our study examined the expression of mRNA of these genes in previously described transcriptome data sets of medulloblastoma patient samples from the Cavalli Cohort (n = 763). Survival distribution was estimated according to the Kaplan-Meier method using a median cut-off and log-rank statistics (p ≤ 0.05). In non-WNT and non-SHH medulloblastoma Group 4 (n = 264), the high expression of ENTPD1 and NT5E was significantly related to a lower overall survival (p = 2.7e-04; p = 2.6e-03). In the SHH-activated group (n = 172), the high expression of ENTPD1 was significantly related to lower overall survival (p = 7.8e-03), while the high expression of NT5E was significantly related to greater overall survival (p = 0.017). In the WNT group (n = 63), the expressions of ENTPD1 and NT5E were not significantly correlated with overall survival (p = 0.212; p = 0.101). In non-WNT and non-SHH medulloblastoma Group 3 (n = 113), the high expression of ENTPD1 was significantly related to greater survival (p = 0.034), while expression of NT5E was not significantly related to survival of patients (p = 0.124). This in silico analysis indicates that ENTPD1 (CD39) and NT5E (CD73) can be seen as potential prognostic markers and therapeutic targets for primary medulloblastomas in non-WNT and non-SHH Group 4.