COVID-19パンデミックが小児の血流感染症に及ぼす影響とグラム陽性菌の抗菌薬耐性表現型の変化、2020～2022年

The impact of the COVID-19 pandemic on pediatric bloodstream infections and alteration in antimicrobial resistance phenotypes in Gram-positive bacteria, 2020-2022.

抄録

背景:

コロナウイルス感染症2019（COVID-19）パンデミック時の小児血流感染症（BSI）の病因および抗菌薬耐性（AMR）の変化はよくわかっていない。本研究は、COVID-19パンデミックが小児のBSIおよびグラム陽性菌の抗菌薬耐性表現型の変化に及ぼす影響を調査することを目的とした。

BACKGROUND: Alteration in the etiology of pediatric bloodstream infections (BSIs) and antimicrobial resistance (AMR) is not well known during the Coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. This study aimed to investigate the impact of the COVID-19 pandemic on pediatric BSIs and alteration in antimicrobial resistance phenotypes in Gram-positive bacteria.

方法:

2020年2月から2022年12月まで、イラン、テヘランの3次小児病院において、18歳未満の小児のBSI頻度をレトロスペクティブに記録した。逆転写ポリメラーゼ連鎖反応を用いたCOVID-19の感染状況、BACTEC 9120培養システムの結果による菌血症/真菌血症、生化学検査を用いた細菌の特徴、およびディスク拡散法を用いたグラム陽性菌分離株の抗菌薬感受性パターンを決定した。COVID-19感染とBSIおよびAMRとの相関を測定するために統計解析を行った。

METHODS: The frequency of BSIs among children under 18 years old was retrospectively recorded in a tertiary children's hospital in Tehran, Iran from February 2020 to December 2022. The status of COVID-19 infection using reverse transcription polymerase chain reaction, bacteremia/fungemia according to BACTEC 9120 Culture System results, characterization of bacteria using biochemical tests, and antimicrobial susceptibility patterns for Gram-positive bacterial isolates using disk diffusion method were determined. Statistical analysis was done to measure the correlation of COVID-19 infection with BSIs and AMR.

結果:

13,345件のCOVID-19検査および4,194件のBACTEC血液培養依頼のうち、両検査を同時に依頼した患者の10.37％（435/4,194）で菌血症/真菌症が確認された。菌血症・真菌症患者の25.3％（110/435）でCOVID-19感染が確認された。特徴的なグラム陽性菌（GPB）の感染は32.3％（140/433例），真菌の感染は8.31％（36/433例）であった．コアグラーゼ陰性ブドウ球菌（CNS、72例、16.62％）、黄色ブドウ球菌（36例、8.3％）、腸球菌属（22例、5％）が多く分離された。カンジダ属は6.7％、非カンジダ属酵母は13.4％であった。CNS菌血症とCOVID-19感染との間に正の相関が認められた（p値＝0.019）。抗生物質感受性試験の結果，CNSではアジスロマイシン，S. aureusではアジスロマイシンとテトラサイクリン，Enterococcus属ではテトラサイクリンに対する耐性頻度が最も高かった．aureus（MRSA）およびcoagulase-negative Staphylococcus spp.（MR-CNS）のメチシリン耐性表現型は、それぞれ40％および61.5％の株で検出され、腸球菌は33.3％の株でバンコマイシンに耐性であった。

RESULTS: Out of 13,345 COVID-19 tests and 4,194 BACTEC blood culture requests, bacteremia/fungemia were confirmed in 10.37% (435/4,194) of the patients who requested both tests simultaneously. The COVID-19 infection was confirmed in 25.3% (110/435) of the patients with bacteremia/fungemia. The infection with characterized Gram-positive bacteria (GPB) and fungi was detected in 32.3% (140/433) and 8.31% (36/433) of the cases, respectively. Coagulase-negative Staphylococcus (CNS, 72, 16.62%), S. aureus (36, 8.3%), and Enterococcus spp. (22, 5%) were among the common isolates. Candida spp. and non-Candida yeasts were detected in 6.7% and 13.4% of the cases, respectively. A positive correlation was shown between the CNS bacteremia and COVID-19 infection (p-value = 0.019). Antibiotic susceptibility testing results showed the highest frequency of resistance to azithromycin among CNS, azithromycin and tetracycline among S. aureus and tetracycline among Enterococcus spp. Methicillin-resistance phenotype in the S. aureus (MRSA) and coagulase-negative Staphylococcus spp. (MR-CNS) was detected in 40% and 61.5% of the strains, respectively and the Enterococci were resistant to vancomycin in 33.3% of the isolates.

結論:

COVID-19パンデミック期間中、小児ではGPBによるBSIの傾向の低下とAMRの増加が示された。抗生物質耐性の増加が懸念されるが、クロラムフェニコール、リネゾリド、およびバンコマイシンは、GPB-BSIの一般的な原因に対して依然として有効である。

CONCLUSION: A decline in the trend of BSIs by GPB and an increase in AMR was shown in children during the COVID-19 pandemic. Increasing antibiotic resistance is a concern; however, chloramphenicol, linezolid, and vancomycin remain active against common causes of GPB-BSIs.