脊髄性筋萎縮症から鎌状赤血球症までの新生児スクリーニングにおけるモジュール遺伝学的アプローチ-遺伝学的新生児スクリーニングの6年間の結果

A Modular Genetic Approach to Newborn Screening from Spinal Muscular Atrophy to Sickle Cell Disease-Results from Six Years of Genetic Newborn Screening.

抄録

背景／目的:

遺伝学的新生児スクリーニング（NBS）は、すでに多くの国で一般的に行われる段階に入っている。ドイツでは現在、脊髄性筋萎縮症（SMA）、重症複合免疫不全症（SCID）、鎌状赤血球症（SCD）がNBSの必須項目となっている。ここでは、ドイツにおけるこれら3疾患の有病率を含む、遺伝的NBSの6年間の経験について述べる。

BACKGROUND/OBJECTIVES: Genetic newborn screening (NBS) has already entered the phase of common practice in many countries. In Germany, spinal muscular atrophy (SMA), severe combined immunodeficiency (SCID) and sickle cell disease (SCD) are currently a mandatory part of NBS. Here, we describe the experience of six years of genetic NBS including the prevalence of those three diseases in Germany.

方法:

NBSに一般的に使用される乾燥血液スポットカードからサンプルと核酸を抽出した。SMAとSCDの疾患原因変異を検出するためにqPCRアッセイを用い、SCIDスクリーニングのためにT細胞受容体切除円（TREC）の検出を行った。

METHODS: Samples and nucleic acids were extracted from dried blood spot cards, commonly used for NBS. A qPCR assay was used to detect disease-causing variants for SMA and SCD, and the detection of T-cell receptor excision circles (TRECs) was performed for SCID screening.

結果:

SMAについては100万人以上、SCIDについては約77万人、SCDについては41万人以上の新生児を対象としたNBSの結果について詳述する。これらの新生児において、121例のSMA、15例のSCIDおよび症候群性免疫不全症、77例のSCDまたはβ-サラセミアを同定した。

RESULTS: The results of the NBS of over 1 million newborns for SMA, approximately 770,000 for SCID and over 410,000 for SCD are discussed in detail. In these newborns, we have identified 121 cases of SMA, 15 cases of SCID and syndrome-based immunodeficiencies and 77 cases of SCD or β-thalassemia.

結論:

multiplex qPCRの柔軟性は、スクリーニングのために様々な分子遺伝マーカーを組み込むための効果的なツールとして評価される。分子遺伝学的アッセイ用の乾燥血液スポット（DBS）フィルターカードの処理とアッセイについて詳細に説明する。同定された症例は、スクリーニングされた新生児の総数から予想される範囲内であるが、ドイツの実際の有病率についてより正確な見解を示している。

CONCLUSIONS: The flexibility of multiplex qPCR is assessed as an effective tool for incorporating different molecular genetic markers for screening. The processing of dried blood spot (DBS) filter cards for molecular genetic assays and the assays are described in detail; turn-around times and cost estimations are included to give an insight into the processes and discuss further options for optimization. The identified cases are in the range expected for the total number of screened newborns, but present a more exact view on the actual prevalences for Germany.